Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y252

RNF6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF6Q9Y252 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF6Q9Y252 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF6Q9Y252 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF6Q9Y252 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF6Q9Y252 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF6Q9Y252 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF6Q9Y252 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF6Q9Y252 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF6Q9Y252 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF6Q9Y252 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF6Q9Y252 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF6Q9Y252 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF6Q9Y252 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF6Q9Y252 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF6Q9Y252 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF6Q9Y252 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF6Q9Y252 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF6Q9Y252 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF6Q9Y252 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF6Q9Y252 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF6Q9Y252 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF6Q9Y252 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF6Q9Y252 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF6Q9Y252 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF6Q9Y252 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF6Q9Y252 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF6Q9Y252 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF6Q9Y252 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF6Q9Y252 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF6Q9Y252 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF6Q9Y252 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF6Q9Y252 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF6Q9Y252 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF6Q9Y252 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF6Q9Y252 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF6Q9Y252 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF6Q9Y252 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF6Q9Y252 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF6Q9Y252 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF6Q9Y252 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF6Q9Y252 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF6Q9Y252 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF6Q9Y252 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF6Q9Y252 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF6Q9Y252 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF6Q9Y252 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF6Q9Y252 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF6Q9Y252 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF6Q9Y252 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF6Q9Y252 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF6Q9Y252 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF6Q9Y252 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF6Q9Y252 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF6Q9Y252 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF6Q9Y252 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF6Q9Y252 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF6Q9Y252 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF6Q9Y252 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF6Q9Y252 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF6Q9Y252 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF6Q9Y252 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF6Q9Y252 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF6Q9Y252 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF6Q9Y252 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF6Q9Y252 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF6Q9Y252 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF6Q9Y252 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF6Q9Y252 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF6Q9Y252 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF6Q9Y252 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF6Q9Y252 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF6Q9Y252 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF6Q9Y252 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF6Q9Y252 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF6Q9Y252 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF6Q9Y252 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF6Q9Y252 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF6Q9Y252 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF6Q9Y252 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF6Q9Y252 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF6Q9Y252 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF6Q9Y252 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF6Q9Y252 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF6Q9Y252 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF6Q9Y252 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF6Q9Y252 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF6Q9Y252 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF6Q9Y252 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF6Q9Y252 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF6Q9Y252 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF6Q9Y252 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF6Q9Y252 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF6Q9Y252 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF6Q9Y252 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF6Q9Y252 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF6Q9Y252 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF6Q9Y252 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF6Q9Y252 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF6Q9Y252 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF6Q9Y252 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms