Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKU7

ACAD8, Isobutyryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAD8Q9UKU7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACAD8Q9UKU7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACAD8Q9UKU7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACAD8Q9UKU7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACAD8Q9UKU7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACAD8Q9UKU7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACAD8Q9UKU7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACAD8Q9UKU7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACAD8Q9UKU7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACAD8Q9UKU7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACAD8Q9UKU7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACAD8Q9UKU7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACAD8Q9UKU7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACAD8Q9UKU7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACAD8Q9UKU7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACAD8Q9UKU7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACAD8Q9UKU7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACAD8Q9UKU7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACAD8Q9UKU7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACAD8Q9UKU7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACAD8Q9UKU7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ACAD8Q9UKU7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ACAD8Q9UKU7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ACAD8Q9UKU7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ACAD8Q9UKU7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ACAD8Q9UKU7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ACAD8Q9UKU7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACAD8Q9UKU7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ACAD8Q9UKU7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ACAD8Q9UKU7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ACAD8Q9UKU7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ACAD8Q9UKU7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACAD8Q9UKU7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACAD8Q9UKU7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACAD8Q9UKU7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACAD8Q9UKU7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACAD8Q9UKU7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACAD8Q9UKU7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACAD8Q9UKU7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACAD8Q9UKU7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACAD8Q9UKU7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACAD8Q9UKU7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACAD8Q9UKU7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACAD8Q9UKU7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACAD8Q9UKU7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACAD8Q9UKU7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACAD8Q9UKU7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACAD8Q9UKU7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACAD8Q9UKU7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ACAD8Q9UKU7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACAD8Q9UKU7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACAD8Q9UKU7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACAD8Q9UKU7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACAD8Q9UKU7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACAD8Q9UKU7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACAD8Q9UKU7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACAD8Q9UKU7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACAD8Q9UKU7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACAD8Q9UKU7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACAD8Q9UKU7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACAD8Q9UKU7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACAD8Q9UKU7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACAD8Q9UKU7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACAD8Q9UKU7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACAD8Q9UKU7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACAD8Q9UKU7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
ACAD8Q9UKU7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACAD8Q9UKU7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACAD8Q9UKU7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACAD8Q9UKU7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACAD8Q9UKU7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACAD8Q9UKU7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACAD8Q9UKU7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACAD8Q9UKU7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACAD8Q9UKU7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACAD8Q9UKU7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACAD8Q9UKU7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACAD8Q9UKU7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACAD8Q9UKU7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACAD8Q9UKU7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACAD8Q9UKU7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACAD8Q9UKU7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACAD8Q9UKU7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACAD8Q9UKU7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACAD8Q9UKU7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACAD8Q9UKU7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACAD8Q9UKU7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACAD8Q9UKU7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACAD8Q9UKU7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACAD8Q9UKU7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACAD8Q9UKU7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACAD8Q9UKU7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACAD8Q9UKU7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACAD8Q9UKU7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACAD8Q9UKU7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACAD8Q9UKU7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACAD8Q9UKU7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACAD8Q9UKU7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACAD8Q9UKU7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACAD8Q9UKU7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.2 ms