Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK05

GDF2, Growth/differentiation factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF2Q9UK05 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF2Q9UK05 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDF2Q9UK05 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDF2Q9UK05 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDF2Q9UK05 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDF2Q9UK05 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDF2Q9UK05 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDF2Q9UK05 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDF2Q9UK05 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDF2Q9UK05 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDF2Q9UK05 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDF2Q9UK05 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDF2Q9UK05 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDF2Q9UK05 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDF2Q9UK05 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDF2Q9UK05 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDF2Q9UK05 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDF2Q9UK05 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDF2Q9UK05 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDF2Q9UK05 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDF2Q9UK05 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDF2Q9UK05 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDF2Q9UK05 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDF2Q9UK05 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDF2Q9UK05 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDF2Q9UK05 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDF2Q9UK05 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDF2Q9UK05 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GDF2Q9UK05 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDF2Q9UK05 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDF2Q9UK05 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDF2Q9UK05 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDF2Q9UK05 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDF2Q9UK05 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDF2Q9UK05 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDF2Q9UK05 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDF2Q9UK05 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDF2Q9UK05 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
GDF2Q9UK05 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF2Q9UK05 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF2Q9UK05 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF2Q9UK05 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF2Q9UK05 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF2Q9UK05 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF2Q9UK05 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF2Q9UK05 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF2Q9UK05 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF2Q9UK05 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF2Q9UK05 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF2Q9UK05 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF2Q9UK05 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF2Q9UK05 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF2Q9UK05 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GDF2Q9UK05 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GDF2Q9UK05 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDF2Q9UK05 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDF2Q9UK05 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDF2Q9UK05 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDF2Q9UK05 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDF2Q9UK05 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GDF2Q9UK05 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDF2Q9UK05 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDF2Q9UK05 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDF2Q9UK05 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDF2Q9UK05 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDF2Q9UK05 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDF2Q9UK05 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDF2Q9UK05 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDF2Q9UK05 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDF2Q9UK05 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDF2Q9UK05 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDF2Q9UK05 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDF2Q9UK05 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDF2Q9UK05 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDF2Q9UK05 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDF2Q9UK05 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GDF2Q9UK05 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDF2Q9UK05 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDF2Q9UK05 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDF2Q9UK05 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDF2Q9UK05 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDF2Q9UK05 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDF2Q9UK05 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDF2Q9UK05 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF2Q9UK05 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF2Q9UK05 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF2Q9UK05 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF2Q9UK05 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF2Q9UK05 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF2Q9UK05 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF2Q9UK05 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF2Q9UK05 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF2Q9UK05 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF2Q9UK05 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF2Q9UK05 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF2Q9UK05 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF2Q9UK05 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF2Q9UK05 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF2Q9UK05 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF2Q9UK05 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms