Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ68

MSRA, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRAQ9UJ68 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MSRAQ9UJ68 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MSRAQ9UJ68 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MSRAQ9UJ68 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MSRAQ9UJ68 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MSRAQ9UJ68 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MSRAQ9UJ68 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
MSRAQ9UJ68 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MSRAQ9UJ68 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MSRAQ9UJ68 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
MSRAQ9UJ68 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MSRAQ9UJ68 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
MSRAQ9UJ68 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MSRAQ9UJ68 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
MSRAQ9UJ68 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
MSRAQ9UJ68 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MSRAQ9UJ68 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MSRAQ9UJ68 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
MSRAQ9UJ68 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MSRAQ9UJ68 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MSRAQ9UJ68 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MSRAQ9UJ68 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MSRAQ9UJ68 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MSRAQ9UJ68 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MSRAQ9UJ68 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MSRAQ9UJ68 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MSRAQ9UJ68 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MSRAQ9UJ68 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MSRAQ9UJ68 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
MSRAQ9UJ68 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MSRAQ9UJ68 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MSRAQ9UJ68 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MSRAQ9UJ68 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MSRAQ9UJ68 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MSRAQ9UJ68 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MSRAQ9UJ68 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
MSRAQ9UJ68 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
MSRAQ9UJ68 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MSRAQ9UJ68 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
MSRAQ9UJ68 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MSRAQ9UJ68 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MSRAQ9UJ68 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MSRAQ9UJ68 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MSRAQ9UJ68 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MSRAQ9UJ68 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MSRAQ9UJ68 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MSRAQ9UJ68 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MSRAQ9UJ68 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MSRAQ9UJ68 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MSRAQ9UJ68 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
MSRAQ9UJ68 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MSRAQ9UJ68 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MSRAQ9UJ68 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MSRAQ9UJ68 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MSRAQ9UJ68 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MSRAQ9UJ68 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MSRAQ9UJ68 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MSRAQ9UJ68 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MSRAQ9UJ68 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MSRAQ9UJ68 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MSRAQ9UJ68 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MSRAQ9UJ68 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MSRAQ9UJ68 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
MSRAQ9UJ68 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MSRAQ9UJ68 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MSRAQ9UJ68 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MSRAQ9UJ68 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MSRAQ9UJ68 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MSRAQ9UJ68 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MSRAQ9UJ68 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MSRAQ9UJ68 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MSRAQ9UJ68 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MSRAQ9UJ68 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MSRAQ9UJ68 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MSRAQ9UJ68 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MSRAQ9UJ68 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MSRAQ9UJ68 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MSRAQ9UJ68 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MSRAQ9UJ68 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
MSRAQ9UJ68 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MSRAQ9UJ68 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MSRAQ9UJ68 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MSRAQ9UJ68 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MSRAQ9UJ68 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MSRAQ9UJ68 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MSRAQ9UJ68 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MSRAQ9UJ68 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MSRAQ9UJ68 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MSRAQ9UJ68 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MSRAQ9UJ68 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MSRAQ9UJ68 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
MSRAQ9UJ68 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MSRAQ9UJ68 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MSRAQ9UJ68 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
MSRAQ9UJ68 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MSRAQ9UJ68 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MSRAQ9UJ68 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MSRAQ9UJ68 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MSRAQ9UJ68 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MSRAQ9UJ68 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms