Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHK0

NUFIP1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUFIP1Q9UHK0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUFIP1Q9UHK0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUFIP1Q9UHK0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUFIP1Q9UHK0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUFIP1Q9UHK0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUFIP1Q9UHK0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUFIP1Q9UHK0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUFIP1Q9UHK0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUFIP1Q9UHK0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUFIP1Q9UHK0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUFIP1Q9UHK0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUFIP1Q9UHK0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUFIP1Q9UHK0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUFIP1Q9UHK0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUFIP1Q9UHK0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUFIP1Q9UHK0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUFIP1Q9UHK0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NUFIP1Q9UHK0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NUFIP1Q9UHK0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUFIP1Q9UHK0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUFIP1Q9UHK0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUFIP1Q9UHK0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUFIP1Q9UHK0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUFIP1Q9UHK0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUFIP1Q9UHK0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUFIP1Q9UHK0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUFIP1Q9UHK0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUFIP1Q9UHK0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUFIP1Q9UHK0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUFIP1Q9UHK0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUFIP1Q9UHK0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUFIP1Q9UHK0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUFIP1Q9UHK0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NUFIP1Q9UHK0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUFIP1Q9UHK0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUFIP1Q9UHK0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUFIP1Q9UHK0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUFIP1Q9UHK0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NUFIP1Q9UHK0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUFIP1Q9UHK0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUFIP1Q9UHK0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUFIP1Q9UHK0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUFIP1Q9UHK0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUFIP1Q9UHK0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUFIP1Q9UHK0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUFIP1Q9UHK0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUFIP1Q9UHK0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUFIP1Q9UHK0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUFIP1Q9UHK0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUFIP1Q9UHK0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NUFIP1Q9UHK0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUFIP1Q9UHK0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUFIP1Q9UHK0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUFIP1Q9UHK0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUFIP1Q9UHK0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUFIP1Q9UHK0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUFIP1Q9UHK0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUFIP1Q9UHK0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUFIP1Q9UHK0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUFIP1Q9UHK0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUFIP1Q9UHK0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NUFIP1Q9UHK0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUFIP1Q9UHK0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NUFIP1Q9UHK0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUFIP1Q9UHK0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUFIP1Q9UHK0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUFIP1Q9UHK0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUFIP1Q9UHK0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUFIP1Q9UHK0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUFIP1Q9UHK0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUFIP1Q9UHK0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUFIP1Q9UHK0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUFIP1Q9UHK0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUFIP1Q9UHK0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUFIP1Q9UHK0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUFIP1Q9UHK0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUFIP1Q9UHK0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUFIP1Q9UHK0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUFIP1Q9UHK0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUFIP1Q9UHK0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUFIP1Q9UHK0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NUFIP1Q9UHK0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUFIP1Q9UHK0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUFIP1Q9UHK0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUFIP1Q9UHK0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUFIP1Q9UHK0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUFIP1Q9UHK0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NUFIP1Q9UHK0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUFIP1Q9UHK0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUFIP1Q9UHK0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NUFIP1Q9UHK0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUFIP1Q9UHK0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUFIP1Q9UHK0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUFIP1Q9UHK0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUFIP1Q9UHK0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUFIP1Q9UHK0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NUFIP1Q9UHK0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NUFIP1Q9UHK0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUFIP1Q9UHK0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUFIP1Q9UHK0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms