Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
APEX2Q9UBZ4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
APEX2Q9UBZ4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
APEX2Q9UBZ4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
APEX2Q9UBZ4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
APEX2Q9UBZ4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
APEX2Q9UBZ4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
APEX2Q9UBZ4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
APEX2Q9UBZ4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
APEX2Q9UBZ4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
APEX2Q9UBZ4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
APEX2Q9UBZ4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
APEX2Q9UBZ4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
APEX2Q9UBZ4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
APEX2Q9UBZ4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
APEX2Q9UBZ4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
APEX2Q9UBZ4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
APEX2Q9UBZ4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
APEX2Q9UBZ4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
APEX2Q9UBZ4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
APEX2Q9UBZ4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
APEX2Q9UBZ4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
APEX2Q9UBZ4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
APEX2Q9UBZ4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
APEX2Q9UBZ4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
APEX2Q9UBZ4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
APEX2Q9UBZ4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
APEX2Q9UBZ4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
APEX2Q9UBZ4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
APEX2Q9UBZ4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
APEX2Q9UBZ4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
APEX2Q9UBZ4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
APEX2Q9UBZ4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
APEX2Q9UBZ4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
APEX2Q9UBZ4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
APEX2Q9UBZ4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
APEX2Q9UBZ4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
APEX2Q9UBZ4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
APEX2Q9UBZ4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
APEX2Q9UBZ4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
APEX2Q9UBZ4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
APEX2Q9UBZ4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
APEX2Q9UBZ4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
APEX2Q9UBZ4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
APEX2Q9UBZ4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
APEX2Q9UBZ4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
APEX2Q9UBZ4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
APEX2Q9UBZ4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
APEX2Q9UBZ4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APEX2Q9UBZ4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
APEX2Q9UBZ4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
APEX2Q9UBZ4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APEX2Q9UBZ4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
APEX2Q9UBZ4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
APEX2Q9UBZ4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
APEX2Q9UBZ4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
APEX2Q9UBZ4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
APEX2Q9UBZ4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APEX2Q9UBZ4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
APEX2Q9UBZ4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
APEX2Q9UBZ4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
APEX2Q9UBZ4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
APEX2Q9UBZ4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
APEX2Q9UBZ4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
APEX2Q9UBZ4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
APEX2Q9UBZ4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
APEX2Q9UBZ4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
APEX2Q9UBZ4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
APEX2Q9UBZ4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
APEX2Q9UBZ4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
APEX2Q9UBZ4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
APEX2Q9UBZ4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
APEX2Q9UBZ4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
APEX2Q9UBZ4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
APEX2Q9UBZ4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
APEX2Q9UBZ4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
APEX2Q9UBZ4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
APEX2Q9UBZ4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
APEX2Q9UBZ4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APEX2Q9UBZ4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
APEX2Q9UBZ4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
APEX2Q9UBZ4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
APEX2Q9UBZ4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
APEX2Q9UBZ4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
APEX2Q9UBZ4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
APEX2Q9UBZ4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
APEX2Q9UBZ4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
APEX2Q9UBZ4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
APEX2Q9UBZ4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
APEX2Q9UBZ4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
APEX2Q9UBZ4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
APEX2Q9UBZ4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
APEX2Q9UBZ4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
APEX2Q9UBZ4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
APEX2Q9UBZ4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
APEX2Q9UBZ4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
APEX2Q9UBZ4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
APEX2Q9UBZ4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
APEX2Q9UBZ4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
APEX2Q9UBZ4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms