Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
USP35Q9P2H5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
USP35Q9P2H5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
USP35Q9P2H5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
USP35Q9P2H5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
USP35Q9P2H5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
USP35Q9P2H5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
USP35Q9P2H5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
USP35Q9P2H5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
USP35Q9P2H5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
USP35Q9P2H5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
USP35Q9P2H5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
USP35Q9P2H5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
USP35Q9P2H5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
USP35Q9P2H5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
USP35Q9P2H5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
USP35Q9P2H5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
USP35Q9P2H5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
USP35Q9P2H5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
USP35Q9P2H5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
USP35Q9P2H5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
USP35Q9P2H5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
USP35Q9P2H5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
USP35Q9P2H5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
USP35Q9P2H5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
USP35Q9P2H5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
USP35Q9P2H5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
USP35Q9P2H5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
USP35Q9P2H5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
USP35Q9P2H5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
USP35Q9P2H5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
USP35Q9P2H5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
USP35Q9P2H5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
USP35Q9P2H5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
USP35Q9P2H5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
USP35Q9P2H5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
USP35Q9P2H5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
USP35Q9P2H5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
USP35Q9P2H5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
USP35Q9P2H5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
USP35Q9P2H5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
USP35Q9P2H5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
USP35Q9P2H5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
USP35Q9P2H5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
USP35Q9P2H5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
USP35Q9P2H5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
USP35Q9P2H5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
USP35Q9P2H5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
USP35Q9P2H5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
USP35Q9P2H5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
USP35Q9P2H5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
USP35Q9P2H5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
USP35Q9P2H5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
USP35Q9P2H5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
USP35Q9P2H5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
USP35Q9P2H5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
USP35Q9P2H5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
USP35Q9P2H5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
USP35Q9P2H5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
USP35Q9P2H5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
USP35Q9P2H5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
USP35Q9P2H5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
USP35Q9P2H5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
USP35Q9P2H5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
USP35Q9P2H5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
USP35Q9P2H5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
USP35Q9P2H5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
USP35Q9P2H5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
USP35Q9P2H5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
USP35Q9P2H5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
USP35Q9P2H5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
USP35Q9P2H5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
USP35Q9P2H5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
USP35Q9P2H5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
USP35Q9P2H5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
USP35Q9P2H5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
USP35Q9P2H5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
USP35Q9P2H5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
USP35Q9P2H5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
USP35Q9P2H5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
USP35Q9P2H5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
USP35Q9P2H5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
USP35Q9P2H5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
USP35Q9P2H5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
USP35Q9P2H5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
USP35Q9P2H5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
USP35Q9P2H5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
USP35Q9P2H5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
USP35Q9P2H5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
USP35Q9P2H5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
USP35Q9P2H5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
USP35Q9P2H5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
USP35Q9P2H5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
USP35Q9P2H5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
USP35Q9P2H5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
USP35Q9P2H5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
USP35Q9P2H5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
USP35Q9P2H5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
USP35Q9P2H5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
USP35Q9P2H5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms