Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVN3

RIC8B, Synembryn-B, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIC8BQ9NVN3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIC8BQ9NVN3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIC8BQ9NVN3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIC8BQ9NVN3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIC8BQ9NVN3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIC8BQ9NVN3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIC8BQ9NVN3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIC8BQ9NVN3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIC8BQ9NVN3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIC8BQ9NVN3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIC8BQ9NVN3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIC8BQ9NVN3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIC8BQ9NVN3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIC8BQ9NVN3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIC8BQ9NVN3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIC8BQ9NVN3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIC8BQ9NVN3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIC8BQ9NVN3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIC8BQ9NVN3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIC8BQ9NVN3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RIC8BQ9NVN3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIC8BQ9NVN3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIC8BQ9NVN3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIC8BQ9NVN3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIC8BQ9NVN3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIC8BQ9NVN3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIC8BQ9NVN3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIC8BQ9NVN3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIC8BQ9NVN3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIC8BQ9NVN3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIC8BQ9NVN3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIC8BQ9NVN3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIC8BQ9NVN3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIC8BQ9NVN3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIC8BQ9NVN3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RIC8BQ9NVN3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIC8BQ9NVN3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIC8BQ9NVN3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIC8BQ9NVN3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIC8BQ9NVN3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIC8BQ9NVN3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIC8BQ9NVN3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RIC8BQ9NVN3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIC8BQ9NVN3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIC8BQ9NVN3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIC8BQ9NVN3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIC8BQ9NVN3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIC8BQ9NVN3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIC8BQ9NVN3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIC8BQ9NVN3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIC8BQ9NVN3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIC8BQ9NVN3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIC8BQ9NVN3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIC8BQ9NVN3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIC8BQ9NVN3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIC8BQ9NVN3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIC8BQ9NVN3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIC8BQ9NVN3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIC8BQ9NVN3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIC8BQ9NVN3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIC8BQ9NVN3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIC8BQ9NVN3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIC8BQ9NVN3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIC8BQ9NVN3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIC8BQ9NVN3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIC8BQ9NVN3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RIC8BQ9NVN3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RIC8BQ9NVN3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RIC8BQ9NVN3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RIC8BQ9NVN3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIC8BQ9NVN3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIC8BQ9NVN3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RIC8BQ9NVN3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RIC8BQ9NVN3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RIC8BQ9NVN3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIC8BQ9NVN3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIC8BQ9NVN3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIC8BQ9NVN3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIC8BQ9NVN3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIC8BQ9NVN3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIC8BQ9NVN3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIC8BQ9NVN3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RIC8BQ9NVN3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIC8BQ9NVN3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RIC8BQ9NVN3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIC8BQ9NVN3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIC8BQ9NVN3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIC8BQ9NVN3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIC8BQ9NVN3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIC8BQ9NVN3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIC8BQ9NVN3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIC8BQ9NVN3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIC8BQ9NVN3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIC8BQ9NVN3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIC8BQ9NVN3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIC8BQ9NVN3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIC8BQ9NVN3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIC8BQ9NVN3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIC8BQ9NVN3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RIC8BQ9NVN3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms