Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS68

TNFRSF19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF19Q9NS68 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TNFRSF19Q9NS68 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TNFRSF19Q9NS68 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TNFRSF19Q9NS68 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TNFRSF19Q9NS68 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TNFRSF19Q9NS68 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNFRSF19Q9NS68 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNFRSF19Q9NS68 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNFRSF19Q9NS68 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNFRSF19Q9NS68 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNFRSF19Q9NS68 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNFRSF19Q9NS68 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNFRSF19Q9NS68 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNFRSF19Q9NS68 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNFRSF19Q9NS68 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TNFRSF19Q9NS68 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TNFRSF19Q9NS68 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TNFRSF19Q9NS68 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TNFRSF19Q9NS68 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TNFRSF19Q9NS68 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TNFRSF19Q9NS68 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TNFRSF19Q9NS68 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TNFRSF19Q9NS68 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TNFRSF19Q9NS68 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TNFRSF19Q9NS68 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNFRSF19Q9NS68 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNFRSF19Q9NS68 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNFRSF19Q9NS68 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNFRSF19Q9NS68 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNFRSF19Q9NS68 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TNFRSF19Q9NS68 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFRSF19Q9NS68 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFRSF19Q9NS68 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFRSF19Q9NS68 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFRSF19Q9NS68 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFRSF19Q9NS68 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFRSF19Q9NS68 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFRSF19Q9NS68 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFRSF19Q9NS68 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFRSF19Q9NS68 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFRSF19Q9NS68 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFRSF19Q9NS68 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFRSF19Q9NS68 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFRSF19Q9NS68 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFRSF19Q9NS68 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFRSF19Q9NS68 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFRSF19Q9NS68 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFRSF19Q9NS68 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFRSF19Q9NS68 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFRSF19Q9NS68 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFRSF19Q9NS68 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFRSF19Q9NS68 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFRSF19Q9NS68 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFRSF19Q9NS68 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFRSF19Q9NS68 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFRSF19Q9NS68 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFRSF19Q9NS68 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFRSF19Q9NS68 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFRSF19Q9NS68 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFRSF19Q9NS68 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFRSF19Q9NS68 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFRSF19Q9NS68 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFRSF19Q9NS68 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFRSF19Q9NS68 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFRSF19Q9NS68 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFRSF19Q9NS68 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFRSF19Q9NS68 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFRSF19Q9NS68 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFRSF19Q9NS68 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFRSF19Q9NS68 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFRSF19Q9NS68 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFRSF19Q9NS68 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFRSF19Q9NS68 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFRSF19Q9NS68 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFRSF19Q9NS68 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFRSF19Q9NS68 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFRSF19Q9NS68 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFRSF19Q9NS68 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFRSF19Q9NS68 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFRSF19Q9NS68 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFRSF19Q9NS68 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFRSF19Q9NS68 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFRSF19Q9NS68 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFRSF19Q9NS68 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFRSF19Q9NS68 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFRSF19Q9NS68 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TNFRSF19Q9NS68 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TNFRSF19Q9NS68 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFRSF19Q9NS68 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFRSF19Q9NS68 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFRSF19Q9NS68 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFRSF19Q9NS68 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFRSF19Q9NS68 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFRSF19Q9NS68 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFRSF19Q9NS68 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFRSF19Q9NS68 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFRSF19Q9NS68 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFRSF19Q9NS68 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFRSF19Q9NS68 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFRSF19Q9NS68 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms