Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PHACTR1Q9C0D0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHACTR1Q9C0D0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHACTR1Q9C0D0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHACTR1Q9C0D0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PHACTR1Q9C0D0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHACTR1Q9C0D0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHACTR1Q9C0D0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHACTR1Q9C0D0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHACTR1Q9C0D0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHACTR1Q9C0D0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PHACTR1Q9C0D0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHACTR1Q9C0D0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHACTR1Q9C0D0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHACTR1Q9C0D0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHACTR1Q9C0D0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHACTR1Q9C0D0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHACTR1Q9C0D0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHACTR1Q9C0D0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHACTR1Q9C0D0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHACTR1Q9C0D0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHACTR1Q9C0D0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHACTR1Q9C0D0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHACTR1Q9C0D0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHACTR1Q9C0D0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PHACTR1Q9C0D0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHACTR1Q9C0D0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHACTR1Q9C0D0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHACTR1Q9C0D0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHACTR1Q9C0D0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHACTR1Q9C0D0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHACTR1Q9C0D0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHACTR1Q9C0D0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHACTR1Q9C0D0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHACTR1Q9C0D0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHACTR1Q9C0D0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHACTR1Q9C0D0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PHACTR1Q9C0D0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PHACTR1Q9C0D0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHACTR1Q9C0D0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHACTR1Q9C0D0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PHACTR1Q9C0D0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHACTR1Q9C0D0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHACTR1Q9C0D0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHACTR1Q9C0D0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHACTR1Q9C0D0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHACTR1Q9C0D0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHACTR1Q9C0D0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHACTR1Q9C0D0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHACTR1Q9C0D0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHACTR1Q9C0D0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHACTR1Q9C0D0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHACTR1Q9C0D0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHACTR1Q9C0D0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHACTR1Q9C0D0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHACTR1Q9C0D0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHACTR1Q9C0D0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHACTR1Q9C0D0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHACTR1Q9C0D0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHACTR1Q9C0D0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PHACTR1Q9C0D0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHACTR1Q9C0D0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHACTR1Q9C0D0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHACTR1Q9C0D0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHACTR1Q9C0D0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHACTR1Q9C0D0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHACTR1Q9C0D0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHACTR1Q9C0D0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHACTR1Q9C0D0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHACTR1Q9C0D0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHACTR1Q9C0D0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHACTR1Q9C0D0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PHACTR1Q9C0D0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHACTR1Q9C0D0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHACTR1Q9C0D0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHACTR1Q9C0D0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHACTR1Q9C0D0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHACTR1Q9C0D0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHACTR1Q9C0D0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PHACTR1Q9C0D0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHACTR1Q9C0D0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHACTR1Q9C0D0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHACTR1Q9C0D0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHACTR1Q9C0D0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHACTR1Q9C0D0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHACTR1Q9C0D0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHACTR1Q9C0D0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHACTR1Q9C0D0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHACTR1Q9C0D0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHACTR1Q9C0D0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHACTR1Q9C0D0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHACTR1Q9C0D0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHACTR1Q9C0D0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHACTR1Q9C0D0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHACTR1Q9C0D0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHACTR1Q9C0D0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHACTR1Q9C0D0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHACTR1Q9C0D0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHACTR1Q9C0D0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHACTR1Q9C0D0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms