Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM54Q9BYV2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM54Q9BYV2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM54Q9BYV2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM54Q9BYV2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM54Q9BYV2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM54Q9BYV2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM54Q9BYV2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM54Q9BYV2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM54Q9BYV2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM54Q9BYV2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM54Q9BYV2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM54Q9BYV2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM54Q9BYV2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM54Q9BYV2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM54Q9BYV2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM54Q9BYV2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM54Q9BYV2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM54Q9BYV2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM54Q9BYV2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM54Q9BYV2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM54Q9BYV2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM54Q9BYV2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM54Q9BYV2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM54Q9BYV2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM54Q9BYV2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM54Q9BYV2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM54Q9BYV2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM54Q9BYV2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM54Q9BYV2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM54Q9BYV2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM54Q9BYV2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM54Q9BYV2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM54Q9BYV2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM54Q9BYV2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM54Q9BYV2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM54Q9BYV2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM54Q9BYV2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM54Q9BYV2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM54Q9BYV2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM54Q9BYV2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM54Q9BYV2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM54Q9BYV2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM54Q9BYV2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM54Q9BYV2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM54Q9BYV2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM54Q9BYV2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM54Q9BYV2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM54Q9BYV2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM54Q9BYV2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM54Q9BYV2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM54Q9BYV2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM54Q9BYV2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM54Q9BYV2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM54Q9BYV2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM54Q9BYV2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM54Q9BYV2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM54Q9BYV2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM54Q9BYV2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM54Q9BYV2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM54Q9BYV2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM54Q9BYV2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM54Q9BYV2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM54Q9BYV2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM54Q9BYV2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM54Q9BYV2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM54Q9BYV2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM54Q9BYV2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM54Q9BYV2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM54Q9BYV2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM54Q9BYV2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM54Q9BYV2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM54Q9BYV2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM54Q9BYV2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM54Q9BYV2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM54Q9BYV2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM54Q9BYV2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM54Q9BYV2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM54Q9BYV2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM54Q9BYV2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM54Q9BYV2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM54Q9BYV2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM54Q9BYV2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM54Q9BYV2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM54Q9BYV2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM54Q9BYV2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM54Q9BYV2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM54Q9BYV2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM54Q9BYV2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM54Q9BYV2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM54Q9BYV2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM54Q9BYV2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM54Q9BYV2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM54Q9BYV2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM54Q9BYV2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM54Q9BYV2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM54Q9BYV2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM54Q9BYV2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM54Q9BYV2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM54Q9BYV2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms