Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GINS3Q9BRX5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GINS3Q9BRX5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GINS3Q9BRX5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GINS3Q9BRX5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GINS3Q9BRX5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GINS3Q9BRX5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GINS3Q9BRX5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GINS3Q9BRX5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GINS3Q9BRX5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GINS3Q9BRX5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GINS3Q9BRX5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GINS3Q9BRX5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GINS3Q9BRX5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GINS3Q9BRX5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GINS3Q9BRX5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GINS3Q9BRX5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GINS3Q9BRX5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GINS3Q9BRX5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GINS3Q9BRX5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GINS3Q9BRX5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GINS3Q9BRX5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GINS3Q9BRX5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GINS3Q9BRX5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GINS3Q9BRX5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GINS3Q9BRX5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GINS3Q9BRX5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GINS3Q9BRX5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GINS3Q9BRX5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GINS3Q9BRX5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GINS3Q9BRX5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GINS3Q9BRX5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GINS3Q9BRX5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GINS3Q9BRX5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GINS3Q9BRX5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GINS3Q9BRX5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GINS3Q9BRX5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GINS3Q9BRX5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GINS3Q9BRX5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GINS3Q9BRX5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GINS3Q9BRX5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GINS3Q9BRX5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GINS3Q9BRX5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GINS3Q9BRX5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GINS3Q9BRX5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GINS3Q9BRX5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GINS3Q9BRX5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GINS3Q9BRX5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GINS3Q9BRX5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GINS3Q9BRX5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GINS3Q9BRX5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GINS3Q9BRX5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GINS3Q9BRX5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GINS3Q9BRX5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GINS3Q9BRX5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GINS3Q9BRX5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GINS3Q9BRX5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GINS3Q9BRX5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GINS3Q9BRX5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GINS3Q9BRX5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GINS3Q9BRX5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GINS3Q9BRX5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GINS3Q9BRX5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GINS3Q9BRX5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GINS3Q9BRX5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GINS3Q9BRX5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GINS3Q9BRX5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GINS3Q9BRX5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GINS3Q9BRX5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GINS3Q9BRX5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GINS3Q9BRX5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GINS3Q9BRX5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GINS3Q9BRX5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GINS3Q9BRX5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GINS3Q9BRX5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GINS3Q9BRX5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GINS3Q9BRX5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GINS3Q9BRX5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GINS3Q9BRX5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GINS3Q9BRX5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GINS3Q9BRX5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GINS3Q9BRX5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GINS3Q9BRX5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GINS3Q9BRX5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GINS3Q9BRX5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GINS3Q9BRX5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GINS3Q9BRX5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GINS3Q9BRX5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GINS3Q9BRX5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GINS3Q9BRX5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GINS3Q9BRX5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GINS3Q9BRX5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GINS3Q9BRX5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GINS3Q9BRX5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GINS3Q9BRX5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GINS3Q9BRX5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GINS3Q9BRX5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GINS3Q9BRX5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GINS3Q9BRX5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GINS3Q9BRX5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms