Protein–RNA interactions for Protein: Q99732

LITAF, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LITAFQ99732 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LITAFQ99732 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LITAFQ99732 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LITAFQ99732 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LITAFQ99732 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LITAFQ99732 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LITAFQ99732 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LITAFQ99732 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LITAFQ99732 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LITAFQ99732 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LITAFQ99732 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LITAFQ99732 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LITAFQ99732 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LITAFQ99732 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LITAFQ99732 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LITAFQ99732 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LITAFQ99732 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LITAFQ99732 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LITAFQ99732 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LITAFQ99732 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LITAFQ99732 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LITAFQ99732 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LITAFQ99732 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LITAFQ99732 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LITAFQ99732 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LITAFQ99732 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LITAFQ99732 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LITAFQ99732 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LITAFQ99732 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LITAFQ99732 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LITAFQ99732 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LITAFQ99732 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LITAFQ99732 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LITAFQ99732 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LITAFQ99732 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LITAFQ99732 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LITAFQ99732 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LITAFQ99732 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LITAFQ99732 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LITAFQ99732 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LITAFQ99732 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LITAFQ99732 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LITAFQ99732 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LITAFQ99732 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LITAFQ99732 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LITAFQ99732 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LITAFQ99732 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LITAFQ99732 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LITAFQ99732 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LITAFQ99732 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LITAFQ99732 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LITAFQ99732 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LITAFQ99732 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LITAFQ99732 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LITAFQ99732 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LITAFQ99732 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LITAFQ99732 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LITAFQ99732 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LITAFQ99732 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LITAFQ99732 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LITAFQ99732 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LITAFQ99732 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LITAFQ99732 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LITAFQ99732 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LITAFQ99732 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LITAFQ99732 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LITAFQ99732 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LITAFQ99732 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LITAFQ99732 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LITAFQ99732 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LITAFQ99732 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LITAFQ99732 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LITAFQ99732 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LITAFQ99732 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LITAFQ99732 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LITAFQ99732 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LITAFQ99732 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LITAFQ99732 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LITAFQ99732 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LITAFQ99732 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LITAFQ99732 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LITAFQ99732 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LITAFQ99732 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LITAFQ99732 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LITAFQ99732 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LITAFQ99732 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LITAFQ99732 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LITAFQ99732 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LITAFQ99732 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LITAFQ99732 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LITAFQ99732 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LITAFQ99732 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LITAFQ99732 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LITAFQ99732 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LITAFQ99732 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LITAFQ99732 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LITAFQ99732 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LITAFQ99732 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LITAFQ99732 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LITAFQ99732 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms