Protein–RNA interactions for Protein: Q96T76

MMS19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMS19Q96T76 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MMS19Q96T76 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
MMS19Q96T76 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MMS19Q96T76 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MMS19Q96T76 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
MMS19Q96T76 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MMS19Q96T76 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MMS19Q96T76 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MMS19Q96T76 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
MMS19Q96T76 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MMS19Q96T76 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MMS19Q96T76 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MMS19Q96T76 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MMS19Q96T76 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MMS19Q96T76 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MMS19Q96T76 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
MMS19Q96T76 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MMS19Q96T76 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MMS19Q96T76 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MMS19Q96T76 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MMS19Q96T76 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MMS19Q96T76 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MMS19Q96T76 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
MMS19Q96T76 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MMS19Q96T76 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MMS19Q96T76 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MMS19Q96T76 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MMS19Q96T76 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MMS19Q96T76 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MMS19Q96T76 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MMS19Q96T76 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MMS19Q96T76 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MMS19Q96T76 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MMS19Q96T76 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MMS19Q96T76 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MMS19Q96T76 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MMS19Q96T76 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MMS19Q96T76 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MMS19Q96T76 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MMS19Q96T76 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MMS19Q96T76 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MMS19Q96T76 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
MMS19Q96T76 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MMS19Q96T76 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MMS19Q96T76 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MMS19Q96T76 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MMS19Q96T76 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MMS19Q96T76 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MMS19Q96T76 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MMS19Q96T76 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MMS19Q96T76 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MMS19Q96T76 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MMS19Q96T76 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
MMS19Q96T76 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MMS19Q96T76 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MMS19Q96T76 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MMS19Q96T76 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MMS19Q96T76 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MMS19Q96T76 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
MMS19Q96T76 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MMS19Q96T76 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MMS19Q96T76 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MMS19Q96T76 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MMS19Q96T76 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MMS19Q96T76 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MMS19Q96T76 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MMS19Q96T76 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MMS19Q96T76 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MMS19Q96T76 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MMS19Q96T76 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MMS19Q96T76 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MMS19Q96T76 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MMS19Q96T76 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MMS19Q96T76 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MMS19Q96T76 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MMS19Q96T76 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
MMS19Q96T76 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MMS19Q96T76 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MMS19Q96T76 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MMS19Q96T76 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MMS19Q96T76 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MMS19Q96T76 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MMS19Q96T76 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MMS19Q96T76 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MMS19Q96T76 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MMS19Q96T76 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MMS19Q96T76 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MMS19Q96T76 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
MMS19Q96T76 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MMS19Q96T76 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MMS19Q96T76 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MMS19Q96T76 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MMS19Q96T76 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MMS19Q96T76 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MMS19Q96T76 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MMS19Q96T76 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MMS19Q96T76 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MMS19Q96T76 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MMS19Q96T76 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MMS19Q96T76 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms