Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RUFY1Q96T51 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RUFY1Q96T51 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RUFY1Q96T51 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUFY1Q96T51 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUFY1Q96T51 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUFY1Q96T51 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUFY1Q96T51 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RUFY1Q96T51 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RUFY1Q96T51 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RUFY1Q96T51 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RUFY1Q96T51 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RUFY1Q96T51 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RUFY1Q96T51 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RUFY1Q96T51 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUFY1Q96T51 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUFY1Q96T51 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUFY1Q96T51 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUFY1Q96T51 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUFY1Q96T51 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUFY1Q96T51 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUFY1Q96T51 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUFY1Q96T51 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUFY1Q96T51 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUFY1Q96T51 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RUFY1Q96T51 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RUFY1Q96T51 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RUFY1Q96T51 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RUFY1Q96T51 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RUFY1Q96T51 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RUFY1Q96T51 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RUFY1Q96T51 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RUFY1Q96T51 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RUFY1Q96T51 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RUFY1Q96T51 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RUFY1Q96T51 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RUFY1Q96T51 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RUFY1Q96T51 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RUFY1Q96T51 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RUFY1Q96T51 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RUFY1Q96T51 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RUFY1Q96T51 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RUFY1Q96T51 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RUFY1Q96T51 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RUFY1Q96T51 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RUFY1Q96T51 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RUFY1Q96T51 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RUFY1Q96T51 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RUFY1Q96T51 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RUFY1Q96T51 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RUFY1Q96T51 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RUFY1Q96T51 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RUFY1Q96T51 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RUFY1Q96T51 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RUFY1Q96T51 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RUFY1Q96T51 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RUFY1Q96T51 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RUFY1Q96T51 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RUFY1Q96T51 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RUFY1Q96T51 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RUFY1Q96T51 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUFY1Q96T51 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUFY1Q96T51 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUFY1Q96T51 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUFY1Q96T51 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUFY1Q96T51 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RUFY1Q96T51 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RUFY1Q96T51 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RUFY1Q96T51 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RUFY1Q96T51 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RUFY1Q96T51 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RUFY1Q96T51 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RUFY1Q96T51 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RUFY1Q96T51 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RUFY1Q96T51 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RUFY1Q96T51 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RUFY1Q96T51 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RUFY1Q96T51 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUFY1Q96T51 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUFY1Q96T51 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUFY1Q96T51 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUFY1Q96T51 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RUFY1Q96T51 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RUFY1Q96T51 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RUFY1Q96T51 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RUFY1Q96T51 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RUFY1Q96T51 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUFY1Q96T51 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUFY1Q96T51 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUFY1Q96T51 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUFY1Q96T51 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUFY1Q96T51 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUFY1Q96T51 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUFY1Q96T51 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUFY1Q96T51 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RUFY1Q96T51 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RUFY1Q96T51 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RUFY1Q96T51 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RUFY1Q96T51 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RUFY1Q96T51 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms