Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU1

SAMD11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD11Q96NU1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SAMD11Q96NU1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SAMD11Q96NU1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SAMD11Q96NU1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SAMD11Q96NU1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SAMD11Q96NU1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SAMD11Q96NU1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SAMD11Q96NU1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SAMD11Q96NU1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SAMD11Q96NU1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SAMD11Q96NU1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SAMD11Q96NU1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SAMD11Q96NU1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SAMD11Q96NU1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SAMD11Q96NU1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SAMD11Q96NU1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SAMD11Q96NU1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SAMD11Q96NU1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SAMD11Q96NU1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SAMD11Q96NU1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SAMD11Q96NU1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SAMD11Q96NU1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SAMD11Q96NU1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SAMD11Q96NU1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SAMD11Q96NU1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SAMD11Q96NU1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SAMD11Q96NU1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SAMD11Q96NU1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SAMD11Q96NU1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SAMD11Q96NU1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SAMD11Q96NU1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SAMD11Q96NU1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SAMD11Q96NU1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SAMD11Q96NU1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SAMD11Q96NU1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SAMD11Q96NU1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SAMD11Q96NU1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SAMD11Q96NU1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SAMD11Q96NU1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SAMD11Q96NU1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SAMD11Q96NU1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SAMD11Q96NU1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SAMD11Q96NU1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SAMD11Q96NU1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SAMD11Q96NU1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SAMD11Q96NU1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SAMD11Q96NU1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SAMD11Q96NU1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SAMD11Q96NU1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SAMD11Q96NU1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SAMD11Q96NU1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SAMD11Q96NU1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SAMD11Q96NU1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SAMD11Q96NU1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SAMD11Q96NU1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SAMD11Q96NU1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SAMD11Q96NU1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SAMD11Q96NU1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SAMD11Q96NU1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SAMD11Q96NU1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SAMD11Q96NU1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SAMD11Q96NU1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SAMD11Q96NU1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SAMD11Q96NU1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SAMD11Q96NU1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SAMD11Q96NU1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SAMD11Q96NU1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SAMD11Q96NU1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SAMD11Q96NU1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SAMD11Q96NU1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SAMD11Q96NU1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SAMD11Q96NU1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SAMD11Q96NU1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SAMD11Q96NU1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SAMD11Q96NU1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SAMD11Q96NU1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SAMD11Q96NU1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SAMD11Q96NU1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SAMD11Q96NU1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SAMD11Q96NU1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SAMD11Q96NU1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SAMD11Q96NU1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SAMD11Q96NU1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SAMD11Q96NU1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SAMD11Q96NU1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SAMD11Q96NU1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SAMD11Q96NU1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SAMD11Q96NU1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SAMD11Q96NU1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SAMD11Q96NU1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SAMD11Q96NU1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SAMD11Q96NU1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SAMD11Q96NU1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SAMD11Q96NU1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SAMD11Q96NU1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SAMD11Q96NU1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SAMD11Q96NU1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SAMD11Q96NU1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SAMD11Q96NU1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SAMD11Q96NU1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms