Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CAPNS2Q96L46 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CAPNS2Q96L46 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CAPNS2Q96L46 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CAPNS2Q96L46 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CAPNS2Q96L46 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CAPNS2Q96L46 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CAPNS2Q96L46 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CAPNS2Q96L46 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CAPNS2Q96L46 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CAPNS2Q96L46 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CAPNS2Q96L46 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CAPNS2Q96L46 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CAPNS2Q96L46 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
CAPNS2Q96L46 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
CAPNS2Q96L46 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CAPNS2Q96L46 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CAPNS2Q96L46 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CAPNS2Q96L46 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CAPNS2Q96L46 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CAPNS2Q96L46 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CAPNS2Q96L46 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CAPNS2Q96L46 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CAPNS2Q96L46 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CAPNS2Q96L46 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CAPNS2Q96L46 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CAPNS2Q96L46 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CAPNS2Q96L46 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CAPNS2Q96L46 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CAPNS2Q96L46 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CAPNS2Q96L46 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CAPNS2Q96L46 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CAPNS2Q96L46 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CAPNS2Q96L46 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CAPNS2Q96L46 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CAPNS2Q96L46 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CAPNS2Q96L46 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CAPNS2Q96L46 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CAPNS2Q96L46 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CAPNS2Q96L46 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CAPNS2Q96L46 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CAPNS2Q96L46 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CAPNS2Q96L46 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CAPNS2Q96L46 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CAPNS2Q96L46 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CAPNS2Q96L46 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CAPNS2Q96L46 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CAPNS2Q96L46 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CAPNS2Q96L46 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CAPNS2Q96L46 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CAPNS2Q96L46 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CAPNS2Q96L46 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CAPNS2Q96L46 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CAPNS2Q96L46 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CAPNS2Q96L46 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CAPNS2Q96L46 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CAPNS2Q96L46 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CAPNS2Q96L46 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CAPNS2Q96L46 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CAPNS2Q96L46 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CAPNS2Q96L46 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CAPNS2Q96L46 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CAPNS2Q96L46 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CAPNS2Q96L46 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CAPNS2Q96L46 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CAPNS2Q96L46 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CAPNS2Q96L46 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CAPNS2Q96L46 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CAPNS2Q96L46 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CAPNS2Q96L46 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CAPNS2Q96L46 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CAPNS2Q96L46 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CAPNS2Q96L46 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CAPNS2Q96L46 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CAPNS2Q96L46 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CAPNS2Q96L46 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CAPNS2Q96L46 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CAPNS2Q96L46 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CAPNS2Q96L46 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CAPNS2Q96L46 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CAPNS2Q96L46 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CAPNS2Q96L46 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CAPNS2Q96L46 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CAPNS2Q96L46 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CAPNS2Q96L46 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CAPNS2Q96L46 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CAPNS2Q96L46 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CAPNS2Q96L46 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CAPNS2Q96L46 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CAPNS2Q96L46 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CAPNS2Q96L46 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CAPNS2Q96L46 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CAPNS2Q96L46 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CAPNS2Q96L46 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CAPNS2Q96L46 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CAPNS2Q96L46 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CAPNS2Q96L46 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
CAPNS2Q96L46 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CAPNS2Q96L46 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CAPNS2Q96L46 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms