Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG8

MAGED4, Melanoma-associated antigen D4, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGED4Q96JG8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MAGED4Q96JG8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MAGED4Q96JG8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MAGED4Q96JG8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MAGED4Q96JG8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MAGED4Q96JG8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MAGED4Q96JG8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MAGED4Q96JG8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MAGED4Q96JG8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MAGED4Q96JG8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MAGED4Q96JG8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MAGED4Q96JG8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MAGED4Q96JG8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MAGED4Q96JG8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MAGED4Q96JG8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MAGED4Q96JG8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MAGED4Q96JG8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MAGED4Q96JG8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MAGED4Q96JG8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MAGED4Q96JG8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MAGED4Q96JG8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MAGED4Q96JG8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MAGED4Q96JG8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MAGED4Q96JG8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MAGED4Q96JG8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MAGED4Q96JG8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MAGED4Q96JG8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MAGED4Q96JG8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MAGED4Q96JG8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MAGED4Q96JG8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MAGED4Q96JG8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MAGED4Q96JG8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MAGED4Q96JG8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MAGED4Q96JG8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MAGED4Q96JG8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MAGED4Q96JG8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MAGED4Q96JG8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MAGED4Q96JG8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MAGED4Q96JG8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MAGED4Q96JG8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MAGED4Q96JG8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MAGED4Q96JG8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MAGED4Q96JG8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MAGED4Q96JG8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MAGED4Q96JG8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MAGED4Q96JG8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MAGED4Q96JG8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MAGED4Q96JG8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MAGED4Q96JG8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MAGED4Q96JG8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MAGED4Q96JG8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MAGED4Q96JG8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MAGED4Q96JG8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MAGED4Q96JG8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MAGED4Q96JG8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MAGED4Q96JG8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MAGED4Q96JG8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MAGED4Q96JG8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MAGED4Q96JG8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MAGED4Q96JG8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MAGED4Q96JG8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MAGED4Q96JG8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MAGED4Q96JG8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MAGED4Q96JG8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MAGED4Q96JG8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MAGED4Q96JG8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MAGED4Q96JG8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MAGED4Q96JG8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MAGED4Q96JG8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MAGED4Q96JG8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MAGED4Q96JG8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MAGED4Q96JG8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MAGED4Q96JG8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MAGED4Q96JG8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MAGED4Q96JG8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MAGED4Q96JG8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MAGED4Q96JG8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MAGED4Q96JG8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MAGED4Q96JG8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MAGED4Q96JG8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MAGED4Q96JG8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MAGED4Q96JG8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MAGED4Q96JG8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MAGED4Q96JG8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MAGED4Q96JG8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MAGED4Q96JG8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MAGED4Q96JG8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MAGED4Q96JG8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MAGED4Q96JG8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MAGED4Q96JG8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MAGED4Q96JG8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MAGED4Q96JG8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MAGED4Q96JG8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MAGED4Q96JG8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MAGED4Q96JG8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MAGED4Q96JG8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MAGED4Q96JG8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MAGED4Q96JG8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MAGED4Q96JG8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MAGED4Q96JG8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms