Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
PRG4Q92954 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
PRG4Q92954 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
PRG4Q92954 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC41.17■■■■■ 4.18
PRG4Q92954 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC41.17■■■■■ 4.18
PRG4Q92954 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
PRG4Q92954 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
PRG4Q92954 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
PRG4Q92954 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC41.14■■■■■ 4.18
PRG4Q92954 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
PRG4Q92954 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
PRG4Q92954 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
PRG4Q92954 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
PRG4Q92954 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
PRG4Q92954 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
PRG4Q92954 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC41.1■■■■■ 4.17
PRG4Q92954 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
PRG4Q92954 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.1■■■■■ 4.17
PRG4Q92954 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
PRG4Q92954 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC41.09■■■■■ 4.17
PRG4Q92954 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC41.09■■■■■ 4.17
PRG4Q92954 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
PRG4Q92954 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
PRG4Q92954 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC41.07■■■■■ 4.16
PRG4Q92954 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
PRG4Q92954 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC41.07■■■■■ 4.16
PRG4Q92954 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.06■■■■■ 4.16
PRG4Q92954 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
PRG4Q92954 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC41.03■■■■■ 4.16
PRG4Q92954 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
PRG4Q92954 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
PRG4Q92954 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
PRG4Q92954 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
PRG4Q92954 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
PRG4Q92954 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
PRG4Q92954 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.16
PRG4Q92954 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
PRG4Q92954 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC41■■■■■ 4.15
PRG4Q92954 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC41■■■■■ 4.15
PRG4Q92954 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
PRG4Q92954 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
PRG4Q92954 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC41■■■■■ 4.15
PRG4Q92954 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
PRG4Q92954 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
PRG4Q92954 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
PRG4Q92954 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
PRG4Q92954 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
PRG4Q92954 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
PRG4Q92954 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
PRG4Q92954 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
PRG4Q92954 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
PRG4Q92954 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
PRG4Q92954 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC40.95■■■■■ 4.15
PRG4Q92954 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC40.95■■■■■ 4.15
PRG4Q92954 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
PRG4Q92954 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
PRG4Q92954 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC40.93■■■■■ 4.14
PRG4Q92954 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
PRG4Q92954 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
PRG4Q92954 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
PRG4Q92954 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
PRG4Q92954 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
PRG4Q92954 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
PRG4Q92954 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
PRG4Q92954 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
PRG4Q92954 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC40.92■■■■■ 4.14
PRG4Q92954 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC40.91■■■■■ 4.14
PRG4Q92954 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC40.91■■■■■ 4.14
PRG4Q92954 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
PRG4Q92954 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
PRG4Q92954 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
PRG4Q92954 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
PRG4Q92954 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
PRG4Q92954 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
PRG4Q92954 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC40.89■■■■■ 4.14
PRG4Q92954 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
PRG4Q92954 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
PRG4Q92954 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
PRG4Q92954 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
PRG4Q92954 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC40.86■■■■■ 4.13
PRG4Q92954 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
PRG4Q92954 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC40.85■■■■■ 4.13
PRG4Q92954 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC40.85■■■■■ 4.13
PRG4Q92954 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
PRG4Q92954 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
PRG4Q92954 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
PRG4Q92954 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
PRG4Q92954 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
PRG4Q92954 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC40.84■■■■■ 4.13
PRG4Q92954 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
PRG4Q92954 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
PRG4Q92954 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
PRG4Q92954 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC40.83■■■■■ 4.13
PRG4Q92954 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC40.82■■■■■ 4.13
PRG4Q92954 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
PRG4Q92954 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.82■■■■■ 4.12
PRG4Q92954 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC40.82■■■■■ 4.12
PRG4Q92954 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.12
PRG4Q92954 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
PRG4Q92954 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms