Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE85

GRHL3, Grainyhead-like protein 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRHL3Q8TE85 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRHL3Q8TE85 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRHL3Q8TE85 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRHL3Q8TE85 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRHL3Q8TE85 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRHL3Q8TE85 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRHL3Q8TE85 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRHL3Q8TE85 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRHL3Q8TE85 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GRHL3Q8TE85 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRHL3Q8TE85 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRHL3Q8TE85 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRHL3Q8TE85 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRHL3Q8TE85 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRHL3Q8TE85 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRHL3Q8TE85 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRHL3Q8TE85 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRHL3Q8TE85 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRHL3Q8TE85 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRHL3Q8TE85 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRHL3Q8TE85 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRHL3Q8TE85 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRHL3Q8TE85 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRHL3Q8TE85 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRHL3Q8TE85 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRHL3Q8TE85 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRHL3Q8TE85 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRHL3Q8TE85 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRHL3Q8TE85 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRHL3Q8TE85 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRHL3Q8TE85 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GRHL3Q8TE85 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRHL3Q8TE85 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRHL3Q8TE85 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRHL3Q8TE85 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRHL3Q8TE85 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRHL3Q8TE85 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRHL3Q8TE85 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRHL3Q8TE85 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRHL3Q8TE85 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRHL3Q8TE85 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRHL3Q8TE85 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRHL3Q8TE85 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRHL3Q8TE85 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRHL3Q8TE85 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRHL3Q8TE85 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRHL3Q8TE85 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRHL3Q8TE85 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GRHL3Q8TE85 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRHL3Q8TE85 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRHL3Q8TE85 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRHL3Q8TE85 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRHL3Q8TE85 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRHL3Q8TE85 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRHL3Q8TE85 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRHL3Q8TE85 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRHL3Q8TE85 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRHL3Q8TE85 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRHL3Q8TE85 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRHL3Q8TE85 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRHL3Q8TE85 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRHL3Q8TE85 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRHL3Q8TE85 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRHL3Q8TE85 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GRHL3Q8TE85 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRHL3Q8TE85 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRHL3Q8TE85 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRHL3Q8TE85 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRHL3Q8TE85 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRHL3Q8TE85 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRHL3Q8TE85 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRHL3Q8TE85 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRHL3Q8TE85 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GRHL3Q8TE85 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRHL3Q8TE85 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRHL3Q8TE85 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRHL3Q8TE85 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRHL3Q8TE85 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRHL3Q8TE85 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRHL3Q8TE85 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRHL3Q8TE85 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRHL3Q8TE85 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRHL3Q8TE85 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRHL3Q8TE85 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRHL3Q8TE85 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRHL3Q8TE85 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GRHL3Q8TE85 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRHL3Q8TE85 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRHL3Q8TE85 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRHL3Q8TE85 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRHL3Q8TE85 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRHL3Q8TE85 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRHL3Q8TE85 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRHL3Q8TE85 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRHL3Q8TE85 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRHL3Q8TE85 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRHL3Q8TE85 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRHL3Q8TE85 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRHL3Q8TE85 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRHL3Q8TE85 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms