Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC05

MDM1, Nuclear protein MDM1, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM1Q8TC05 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MDM1Q8TC05 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MDM1Q8TC05 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MDM1Q8TC05 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MDM1Q8TC05 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MDM1Q8TC05 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MDM1Q8TC05 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MDM1Q8TC05 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MDM1Q8TC05 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MDM1Q8TC05 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MDM1Q8TC05 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MDM1Q8TC05 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MDM1Q8TC05 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MDM1Q8TC05 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MDM1Q8TC05 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MDM1Q8TC05 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MDM1Q8TC05 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MDM1Q8TC05 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MDM1Q8TC05 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MDM1Q8TC05 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MDM1Q8TC05 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MDM1Q8TC05 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MDM1Q8TC05 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MDM1Q8TC05 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MDM1Q8TC05 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MDM1Q8TC05 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MDM1Q8TC05 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
MDM1Q8TC05 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
MDM1Q8TC05 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
MDM1Q8TC05 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MDM1Q8TC05 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MDM1Q8TC05 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MDM1Q8TC05 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MDM1Q8TC05 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MDM1Q8TC05 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MDM1Q8TC05 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MDM1Q8TC05 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MDM1Q8TC05 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
MDM1Q8TC05 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MDM1Q8TC05 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MDM1Q8TC05 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MDM1Q8TC05 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MDM1Q8TC05 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MDM1Q8TC05 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MDM1Q8TC05 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MDM1Q8TC05 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MDM1Q8TC05 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MDM1Q8TC05 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MDM1Q8TC05 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MDM1Q8TC05 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MDM1Q8TC05 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MDM1Q8TC05 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MDM1Q8TC05 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MDM1Q8TC05 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MDM1Q8TC05 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MDM1Q8TC05 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MDM1Q8TC05 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
MDM1Q8TC05 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MDM1Q8TC05 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MDM1Q8TC05 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MDM1Q8TC05 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MDM1Q8TC05 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MDM1Q8TC05 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MDM1Q8TC05 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MDM1Q8TC05 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MDM1Q8TC05 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MDM1Q8TC05 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MDM1Q8TC05 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MDM1Q8TC05 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MDM1Q8TC05 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MDM1Q8TC05 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MDM1Q8TC05 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MDM1Q8TC05 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MDM1Q8TC05 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MDM1Q8TC05 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MDM1Q8TC05 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
MDM1Q8TC05 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MDM1Q8TC05 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MDM1Q8TC05 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MDM1Q8TC05 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MDM1Q8TC05 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MDM1Q8TC05 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MDM1Q8TC05 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MDM1Q8TC05 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MDM1Q8TC05 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MDM1Q8TC05 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MDM1Q8TC05 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MDM1Q8TC05 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MDM1Q8TC05 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MDM1Q8TC05 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MDM1Q8TC05 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MDM1Q8TC05 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MDM1Q8TC05 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MDM1Q8TC05 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MDM1Q8TC05 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MDM1Q8TC05 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MDM1Q8TC05 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MDM1Q8TC05 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MDM1Q8TC05 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MDM1Q8TC05 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms