Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CENPPQ6IPU0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CENPPQ6IPU0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CENPPQ6IPU0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CENPPQ6IPU0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CENPPQ6IPU0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CENPPQ6IPU0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CENPPQ6IPU0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CENPPQ6IPU0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CENPPQ6IPU0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CENPPQ6IPU0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CENPPQ6IPU0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CENPPQ6IPU0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CENPPQ6IPU0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CENPPQ6IPU0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CENPPQ6IPU0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CENPPQ6IPU0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CENPPQ6IPU0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CENPPQ6IPU0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CENPPQ6IPU0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CENPPQ6IPU0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CENPPQ6IPU0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CENPPQ6IPU0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CENPPQ6IPU0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CENPPQ6IPU0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CENPPQ6IPU0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CENPPQ6IPU0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CENPPQ6IPU0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CENPPQ6IPU0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CENPPQ6IPU0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CENPPQ6IPU0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CENPPQ6IPU0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CENPPQ6IPU0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CENPPQ6IPU0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CENPPQ6IPU0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CENPPQ6IPU0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CENPPQ6IPU0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CENPPQ6IPU0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CENPPQ6IPU0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CENPPQ6IPU0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CENPPQ6IPU0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CENPPQ6IPU0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CENPPQ6IPU0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CENPPQ6IPU0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CENPPQ6IPU0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CENPPQ6IPU0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CENPPQ6IPU0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CENPPQ6IPU0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CENPPQ6IPU0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CENPPQ6IPU0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CENPPQ6IPU0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CENPPQ6IPU0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CENPPQ6IPU0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CENPPQ6IPU0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CENPPQ6IPU0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CENPPQ6IPU0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CENPPQ6IPU0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CENPPQ6IPU0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CENPPQ6IPU0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CENPPQ6IPU0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CENPPQ6IPU0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CENPPQ6IPU0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CENPPQ6IPU0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CENPPQ6IPU0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CENPPQ6IPU0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CENPPQ6IPU0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CENPPQ6IPU0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CENPPQ6IPU0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CENPPQ6IPU0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CENPPQ6IPU0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CENPPQ6IPU0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CENPPQ6IPU0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CENPPQ6IPU0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CENPPQ6IPU0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CENPPQ6IPU0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CENPPQ6IPU0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CENPPQ6IPU0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CENPPQ6IPU0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CENPPQ6IPU0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CENPPQ6IPU0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CENPPQ6IPU0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CENPPQ6IPU0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CENPPQ6IPU0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CENPPQ6IPU0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CENPPQ6IPU0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CENPPQ6IPU0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CENPPQ6IPU0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CENPPQ6IPU0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CENPPQ6IPU0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CENPPQ6IPU0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CENPPQ6IPU0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CENPPQ6IPU0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CENPPQ6IPU0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CENPPQ6IPU0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CENPPQ6IPU0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CENPPQ6IPU0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CENPPQ6IPU0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CENPPQ6IPU0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CENPPQ6IPU0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CENPPQ6IPU0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms