Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGAP9Q5VTM2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGAP9Q5VTM2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGAP9Q5VTM2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGAP9Q5VTM2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
AGAP9Q5VTM2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGAP9Q5VTM2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGAP9Q5VTM2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AGAP9Q5VTM2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AGAP9Q5VTM2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AGAP9Q5VTM2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AGAP9Q5VTM2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AGAP9Q5VTM2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
AGAP9Q5VTM2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AGAP9Q5VTM2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AGAP9Q5VTM2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AGAP9Q5VTM2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AGAP9Q5VTM2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AGAP9Q5VTM2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AGAP9Q5VTM2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AGAP9Q5VTM2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AGAP9Q5VTM2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AGAP9Q5VTM2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
AGAP9Q5VTM2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AGAP9Q5VTM2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
AGAP9Q5VTM2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AGAP9Q5VTM2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AGAP9Q5VTM2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AGAP9Q5VTM2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
AGAP9Q5VTM2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AGAP9Q5VTM2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AGAP9Q5VTM2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGAP9Q5VTM2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGAP9Q5VTM2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGAP9Q5VTM2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
AGAP9Q5VTM2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
AGAP9Q5VTM2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
AGAP9Q5VTM2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
AGAP9Q5VTM2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
AGAP9Q5VTM2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
AGAP9Q5VTM2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
AGAP9Q5VTM2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AGAP9Q5VTM2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AGAP9Q5VTM2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AGAP9Q5VTM2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AGAP9Q5VTM2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AGAP9Q5VTM2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
AGAP9Q5VTM2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AGAP9Q5VTM2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
AGAP9Q5VTM2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AGAP9Q5VTM2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AGAP9Q5VTM2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AGAP9Q5VTM2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AGAP9Q5VTM2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AGAP9Q5VTM2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AGAP9Q5VTM2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AGAP9Q5VTM2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AGAP9Q5VTM2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AGAP9Q5VTM2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AGAP9Q5VTM2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
AGAP9Q5VTM2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AGAP9Q5VTM2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
AGAP9Q5VTM2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AGAP9Q5VTM2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AGAP9Q5VTM2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AGAP9Q5VTM2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AGAP9Q5VTM2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AGAP9Q5VTM2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AGAP9Q5VTM2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AGAP9Q5VTM2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AGAP9Q5VTM2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AGAP9Q5VTM2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AGAP9Q5VTM2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AGAP9Q5VTM2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
AGAP9Q5VTM2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AGAP9Q5VTM2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AGAP9Q5VTM2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AGAP9Q5VTM2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AGAP9Q5VTM2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AGAP9Q5VTM2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AGAP9Q5VTM2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AGAP9Q5VTM2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AGAP9Q5VTM2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AGAP9Q5VTM2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AGAP9Q5VTM2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AGAP9Q5VTM2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AGAP9Q5VTM2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AGAP9Q5VTM2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AGAP9Q5VTM2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AGAP9Q5VTM2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AGAP9Q5VTM2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AGAP9Q5VTM2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AGAP9Q5VTM2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AGAP9Q5VTM2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AGAP9Q5VTM2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AGAP9Q5VTM2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AGAP9Q5VTM2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AGAP9Q5VTM2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGAP9Q5VTM2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGAP9Q5VTM2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms