Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATAD3CQ5T2N8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATAD3CQ5T2N8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATAD3CQ5T2N8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATAD3CQ5T2N8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATAD3CQ5T2N8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATAD3CQ5T2N8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATAD3CQ5T2N8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATAD3CQ5T2N8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATAD3CQ5T2N8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATAD3CQ5T2N8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATAD3CQ5T2N8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATAD3CQ5T2N8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATAD3CQ5T2N8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATAD3CQ5T2N8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATAD3CQ5T2N8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATAD3CQ5T2N8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATAD3CQ5T2N8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATAD3CQ5T2N8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATAD3CQ5T2N8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATAD3CQ5T2N8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATAD3CQ5T2N8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATAD3CQ5T2N8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATAD3CQ5T2N8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATAD3CQ5T2N8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ATAD3CQ5T2N8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATAD3CQ5T2N8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATAD3CQ5T2N8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATAD3CQ5T2N8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATAD3CQ5T2N8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATAD3CQ5T2N8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATAD3CQ5T2N8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATAD3CQ5T2N8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATAD3CQ5T2N8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATAD3CQ5T2N8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATAD3CQ5T2N8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATAD3CQ5T2N8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATAD3CQ5T2N8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATAD3CQ5T2N8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATAD3CQ5T2N8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATAD3CQ5T2N8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATAD3CQ5T2N8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATAD3CQ5T2N8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATAD3CQ5T2N8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATAD3CQ5T2N8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATAD3CQ5T2N8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATAD3CQ5T2N8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATAD3CQ5T2N8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATAD3CQ5T2N8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ATAD3CQ5T2N8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATAD3CQ5T2N8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATAD3CQ5T2N8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATAD3CQ5T2N8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATAD3CQ5T2N8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATAD3CQ5T2N8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATAD3CQ5T2N8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATAD3CQ5T2N8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ATAD3CQ5T2N8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATAD3CQ5T2N8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATAD3CQ5T2N8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATAD3CQ5T2N8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATAD3CQ5T2N8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATAD3CQ5T2N8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATAD3CQ5T2N8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATAD3CQ5T2N8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATAD3CQ5T2N8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATAD3CQ5T2N8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATAD3CQ5T2N8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATAD3CQ5T2N8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATAD3CQ5T2N8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATAD3CQ5T2N8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATAD3CQ5T2N8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATAD3CQ5T2N8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATAD3CQ5T2N8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAD3CQ5T2N8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAD3CQ5T2N8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAD3CQ5T2N8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAD3CQ5T2N8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAD3CQ5T2N8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAD3CQ5T2N8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATAD3CQ5T2N8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATAD3CQ5T2N8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATAD3CQ5T2N8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATAD3CQ5T2N8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATAD3CQ5T2N8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATAD3CQ5T2N8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATAD3CQ5T2N8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATAD3CQ5T2N8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATAD3CQ5T2N8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATAD3CQ5T2N8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATAD3CQ5T2N8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATAD3CQ5T2N8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATAD3CQ5T2N8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATAD3CQ5T2N8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATAD3CQ5T2N8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ATAD3CQ5T2N8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATAD3CQ5T2N8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATAD3CQ5T2N8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATAD3CQ5T2N8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATAD3CQ5T2N8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms