Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C4orf17Q53FE4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C4orf17Q53FE4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C4orf17Q53FE4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C4orf17Q53FE4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C4orf17Q53FE4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C4orf17Q53FE4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C4orf17Q53FE4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
C4orf17Q53FE4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C4orf17Q53FE4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C4orf17Q53FE4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C4orf17Q53FE4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C4orf17Q53FE4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C4orf17Q53FE4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C4orf17Q53FE4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C4orf17Q53FE4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C4orf17Q53FE4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C4orf17Q53FE4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C4orf17Q53FE4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C4orf17Q53FE4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
C4orf17Q53FE4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C4orf17Q53FE4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C4orf17Q53FE4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C4orf17Q53FE4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C4orf17Q53FE4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C4orf17Q53FE4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C4orf17Q53FE4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C4orf17Q53FE4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
C4orf17Q53FE4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C4orf17Q53FE4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C4orf17Q53FE4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C4orf17Q53FE4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C4orf17Q53FE4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C4orf17Q53FE4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C4orf17Q53FE4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C4orf17Q53FE4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C4orf17Q53FE4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C4orf17Q53FE4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
C4orf17Q53FE4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C4orf17Q53FE4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C4orf17Q53FE4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C4orf17Q53FE4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C4orf17Q53FE4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C4orf17Q53FE4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C4orf17Q53FE4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C4orf17Q53FE4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C4orf17Q53FE4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C4orf17Q53FE4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C4orf17Q53FE4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C4orf17Q53FE4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C4orf17Q53FE4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C4orf17Q53FE4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C4orf17Q53FE4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C4orf17Q53FE4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C4orf17Q53FE4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C4orf17Q53FE4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C4orf17Q53FE4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C4orf17Q53FE4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C4orf17Q53FE4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C4orf17Q53FE4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C4orf17Q53FE4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C4orf17Q53FE4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C4orf17Q53FE4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C4orf17Q53FE4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C4orf17Q53FE4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C4orf17Q53FE4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C4orf17Q53FE4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C4orf17Q53FE4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
C4orf17Q53FE4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C4orf17Q53FE4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C4orf17Q53FE4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C4orf17Q53FE4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C4orf17Q53FE4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
C4orf17Q53FE4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C4orf17Q53FE4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C4orf17Q53FE4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C4orf17Q53FE4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C4orf17Q53FE4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C4orf17Q53FE4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C4orf17Q53FE4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C4orf17Q53FE4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C4orf17Q53FE4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C4orf17Q53FE4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C4orf17Q53FE4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C4orf17Q53FE4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C4orf17Q53FE4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C4orf17Q53FE4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C4orf17Q53FE4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C4orf17Q53FE4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C4orf17Q53FE4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C4orf17Q53FE4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C4orf17Q53FE4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C4orf17Q53FE4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C4orf17Q53FE4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C4orf17Q53FE4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C4orf17Q53FE4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C4orf17Q53FE4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C4orf17Q53FE4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C4orf17Q53FE4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C4orf17Q53FE4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms