Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGAP29Q52LW3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGAP29Q52LW3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGAP29Q52LW3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGAP29Q52LW3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGAP29Q52LW3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGAP29Q52LW3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGAP29Q52LW3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGAP29Q52LW3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGAP29Q52LW3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGAP29Q52LW3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGAP29Q52LW3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGAP29Q52LW3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGAP29Q52LW3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGAP29Q52LW3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGAP29Q52LW3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGAP29Q52LW3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGAP29Q52LW3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGAP29Q52LW3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
ARHGAP29Q52LW3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ARHGAP29Q52LW3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ARHGAP29Q52LW3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ARHGAP29Q52LW3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ARHGAP29Q52LW3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ARHGAP29Q52LW3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ARHGAP29Q52LW3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ARHGAP29Q52LW3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ARHGAP29Q52LW3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ARHGAP29Q52LW3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ARHGAP29Q52LW3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ARHGAP29Q52LW3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ARHGAP29Q52LW3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ARHGAP29Q52LW3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ARHGAP29Q52LW3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ARHGAP29Q52LW3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ARHGAP29Q52LW3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ARHGAP29Q52LW3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ARHGAP29Q52LW3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ARHGAP29Q52LW3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
ARHGAP29Q52LW3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ARHGAP29Q52LW3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ARHGAP29Q52LW3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ARHGAP29Q52LW3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ARHGAP29Q52LW3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ARHGAP29Q52LW3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ARHGAP29Q52LW3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ARHGAP29Q52LW3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ARHGAP29Q52LW3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ARHGAP29Q52LW3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ARHGAP29Q52LW3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
ARHGAP29Q52LW3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARHGAP29Q52LW3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARHGAP29Q52LW3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARHGAP29Q52LW3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARHGAP29Q52LW3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARHGAP29Q52LW3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARHGAP29Q52LW3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARHGAP29Q52LW3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARHGAP29Q52LW3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARHGAP29Q52LW3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARHGAP29Q52LW3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARHGAP29Q52LW3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARHGAP29Q52LW3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARHGAP29Q52LW3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARHGAP29Q52LW3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARHGAP29Q52LW3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARHGAP29Q52LW3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARHGAP29Q52LW3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ARHGAP29Q52LW3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARHGAP29Q52LW3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ARHGAP29Q52LW3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARHGAP29Q52LW3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ARHGAP29Q52LW3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ARHGAP29Q52LW3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARHGAP29Q52LW3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARHGAP29Q52LW3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARHGAP29Q52LW3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARHGAP29Q52LW3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARHGAP29Q52LW3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARHGAP29Q52LW3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARHGAP29Q52LW3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARHGAP29Q52LW3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARHGAP29Q52LW3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARHGAP29Q52LW3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARHGAP29Q52LW3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARHGAP29Q52LW3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARHGAP29Q52LW3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARHGAP29Q52LW3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARHGAP29Q52LW3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARHGAP29Q52LW3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARHGAP29Q52LW3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARHGAP29Q52LW3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARHGAP29Q52LW3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARHGAP29Q52LW3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARHGAP29Q52LW3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARHGAP29Q52LW3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARHGAP29Q52LW3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARHGAP29Q52LW3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARHGAP29Q52LW3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARHGAP29Q52LW3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.7 ms