Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TBRG1Q3YBR2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TBRG1Q3YBR2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TBRG1Q3YBR2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TBRG1Q3YBR2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TBRG1Q3YBR2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TBRG1Q3YBR2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TBRG1Q3YBR2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TBRG1Q3YBR2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TBRG1Q3YBR2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TBRG1Q3YBR2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TBRG1Q3YBR2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TBRG1Q3YBR2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TBRG1Q3YBR2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TBRG1Q3YBR2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TBRG1Q3YBR2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TBRG1Q3YBR2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TBRG1Q3YBR2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TBRG1Q3YBR2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBRG1Q3YBR2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBRG1Q3YBR2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBRG1Q3YBR2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBRG1Q3YBR2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBRG1Q3YBR2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBRG1Q3YBR2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TBRG1Q3YBR2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TBRG1Q3YBR2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBRG1Q3YBR2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBRG1Q3YBR2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBRG1Q3YBR2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TBRG1Q3YBR2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TBRG1Q3YBR2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TBRG1Q3YBR2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TBRG1Q3YBR2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TBRG1Q3YBR2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TBRG1Q3YBR2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TBRG1Q3YBR2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TBRG1Q3YBR2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TBRG1Q3YBR2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TBRG1Q3YBR2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TBRG1Q3YBR2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TBRG1Q3YBR2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TBRG1Q3YBR2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TBRG1Q3YBR2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TBRG1Q3YBR2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TBRG1Q3YBR2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TBRG1Q3YBR2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TBRG1Q3YBR2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TBRG1Q3YBR2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TBRG1Q3YBR2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TBRG1Q3YBR2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TBRG1Q3YBR2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TBRG1Q3YBR2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TBRG1Q3YBR2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TBRG1Q3YBR2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TBRG1Q3YBR2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TBRG1Q3YBR2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TBRG1Q3YBR2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TBRG1Q3YBR2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TBRG1Q3YBR2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TBRG1Q3YBR2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TBRG1Q3YBR2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TBRG1Q3YBR2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TBRG1Q3YBR2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TBRG1Q3YBR2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TBRG1Q3YBR2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TBRG1Q3YBR2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TBRG1Q3YBR2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TBRG1Q3YBR2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TBRG1Q3YBR2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TBRG1Q3YBR2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TBRG1Q3YBR2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TBRG1Q3YBR2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TBRG1Q3YBR2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TBRG1Q3YBR2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TBRG1Q3YBR2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TBRG1Q3YBR2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TBRG1Q3YBR2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TBRG1Q3YBR2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TBRG1Q3YBR2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TBRG1Q3YBR2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TBRG1Q3YBR2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TBRG1Q3YBR2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TBRG1Q3YBR2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TBRG1Q3YBR2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TBRG1Q3YBR2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TBRG1Q3YBR2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TBRG1Q3YBR2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TBRG1Q3YBR2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TBRG1Q3YBR2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TBRG1Q3YBR2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TBRG1Q3YBR2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TBRG1Q3YBR2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TBRG1Q3YBR2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TBRG1Q3YBR2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TBRG1Q3YBR2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TBRG1Q3YBR2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TBRG1Q3YBR2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TBRG1Q3YBR2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TBRG1Q3YBR2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms