Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIR4

TMEM30B, Cell cycle control protein 50B, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30BQ3MIR4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMEM30BQ3MIR4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMEM30BQ3MIR4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMEM30BQ3MIR4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMEM30BQ3MIR4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMEM30BQ3MIR4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMEM30BQ3MIR4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMEM30BQ3MIR4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMEM30BQ3MIR4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM30BQ3MIR4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM30BQ3MIR4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM30BQ3MIR4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM30BQ3MIR4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM30BQ3MIR4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM30BQ3MIR4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM30BQ3MIR4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM30BQ3MIR4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM30BQ3MIR4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM30BQ3MIR4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM30BQ3MIR4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM30BQ3MIR4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM30BQ3MIR4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM30BQ3MIR4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM30BQ3MIR4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM30BQ3MIR4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM30BQ3MIR4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM30BQ3MIR4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM30BQ3MIR4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM30BQ3MIR4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM30BQ3MIR4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM30BQ3MIR4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM30BQ3MIR4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM30BQ3MIR4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM30BQ3MIR4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM30BQ3MIR4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM30BQ3MIR4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM30BQ3MIR4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM30BQ3MIR4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM30BQ3MIR4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM30BQ3MIR4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM30BQ3MIR4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM30BQ3MIR4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM30BQ3MIR4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM30BQ3MIR4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM30BQ3MIR4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM30BQ3MIR4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM30BQ3MIR4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM30BQ3MIR4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM30BQ3MIR4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM30BQ3MIR4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM30BQ3MIR4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM30BQ3MIR4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM30BQ3MIR4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM30BQ3MIR4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM30BQ3MIR4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM30BQ3MIR4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM30BQ3MIR4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM30BQ3MIR4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM30BQ3MIR4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM30BQ3MIR4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM30BQ3MIR4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM30BQ3MIR4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM30BQ3MIR4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM30BQ3MIR4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM30BQ3MIR4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM30BQ3MIR4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM30BQ3MIR4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM30BQ3MIR4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM30BQ3MIR4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM30BQ3MIR4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM30BQ3MIR4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM30BQ3MIR4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM30BQ3MIR4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TMEM30BQ3MIR4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TMEM30BQ3MIR4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM30BQ3MIR4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM30BQ3MIR4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM30BQ3MIR4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM30BQ3MIR4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM30BQ3MIR4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM30BQ3MIR4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM30BQ3MIR4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM30BQ3MIR4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM30BQ3MIR4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM30BQ3MIR4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM30BQ3MIR4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM30BQ3MIR4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM30BQ3MIR4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM30BQ3MIR4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM30BQ3MIR4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM30BQ3MIR4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM30BQ3MIR4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM30BQ3MIR4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM30BQ3MIR4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM30BQ3MIR4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM30BQ3MIR4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM30BQ3MIR4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM30BQ3MIR4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM30BQ3MIR4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM30BQ3MIR4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms