Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHT4

GSG1, Germ cell-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSG1Q2KHT4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSG1Q2KHT4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSG1Q2KHT4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSG1Q2KHT4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSG1Q2KHT4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSG1Q2KHT4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSG1Q2KHT4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSG1Q2KHT4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSG1Q2KHT4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GSG1Q2KHT4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSG1Q2KHT4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSG1Q2KHT4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSG1Q2KHT4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GSG1Q2KHT4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSG1Q2KHT4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSG1Q2KHT4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSG1Q2KHT4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSG1Q2KHT4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSG1Q2KHT4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSG1Q2KHT4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSG1Q2KHT4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSG1Q2KHT4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GSG1Q2KHT4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GSG1Q2KHT4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GSG1Q2KHT4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GSG1Q2KHT4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GSG1Q2KHT4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GSG1Q2KHT4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GSG1Q2KHT4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GSG1Q2KHT4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GSG1Q2KHT4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSG1Q2KHT4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSG1Q2KHT4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSG1Q2KHT4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSG1Q2KHT4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSG1Q2KHT4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSG1Q2KHT4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSG1Q2KHT4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSG1Q2KHT4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSG1Q2KHT4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSG1Q2KHT4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSG1Q2KHT4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSG1Q2KHT4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSG1Q2KHT4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSG1Q2KHT4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSG1Q2KHT4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSG1Q2KHT4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSG1Q2KHT4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSG1Q2KHT4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSG1Q2KHT4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSG1Q2KHT4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSG1Q2KHT4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSG1Q2KHT4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSG1Q2KHT4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSG1Q2KHT4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSG1Q2KHT4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSG1Q2KHT4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSG1Q2KHT4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSG1Q2KHT4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSG1Q2KHT4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSG1Q2KHT4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSG1Q2KHT4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSG1Q2KHT4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSG1Q2KHT4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSG1Q2KHT4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSG1Q2KHT4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSG1Q2KHT4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GSG1Q2KHT4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSG1Q2KHT4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSG1Q2KHT4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSG1Q2KHT4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSG1Q2KHT4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSG1Q2KHT4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSG1Q2KHT4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GSG1Q2KHT4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSG1Q2KHT4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSG1Q2KHT4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSG1Q2KHT4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSG1Q2KHT4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSG1Q2KHT4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSG1Q2KHT4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSG1Q2KHT4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GSG1Q2KHT4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GSG1Q2KHT4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSG1Q2KHT4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GSG1Q2KHT4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSG1Q2KHT4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSG1Q2KHT4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSG1Q2KHT4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSG1Q2KHT4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSG1Q2KHT4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSG1Q2KHT4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSG1Q2KHT4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSG1Q2KHT4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSG1Q2KHT4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSG1Q2KHT4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSG1Q2KHT4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSG1Q2KHT4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSG1Q2KHT4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSG1Q2KHT4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms