Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IMPG1Q17R60 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IMPG1Q17R60 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IMPG1Q17R60 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IMPG1Q17R60 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IMPG1Q17R60 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IMPG1Q17R60 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IMPG1Q17R60 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IMPG1Q17R60 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IMPG1Q17R60 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IMPG1Q17R60 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IMPG1Q17R60 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IMPG1Q17R60 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IMPG1Q17R60 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IMPG1Q17R60 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IMPG1Q17R60 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IMPG1Q17R60 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IMPG1Q17R60 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IMPG1Q17R60 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IMPG1Q17R60 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IMPG1Q17R60 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IMPG1Q17R60 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IMPG1Q17R60 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IMPG1Q17R60 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IMPG1Q17R60 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IMPG1Q17R60 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IMPG1Q17R60 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IMPG1Q17R60 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IMPG1Q17R60 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IMPG1Q17R60 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IMPG1Q17R60 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IMPG1Q17R60 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IMPG1Q17R60 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IMPG1Q17R60 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IMPG1Q17R60 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IMPG1Q17R60 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IMPG1Q17R60 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IMPG1Q17R60 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IMPG1Q17R60 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IMPG1Q17R60 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IMPG1Q17R60 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
IMPG1Q17R60 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IMPG1Q17R60 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IMPG1Q17R60 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IMPG1Q17R60 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IMPG1Q17R60 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IMPG1Q17R60 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
IMPG1Q17R60 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IMPG1Q17R60 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IMPG1Q17R60 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IMPG1Q17R60 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IMPG1Q17R60 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IMPG1Q17R60 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IMPG1Q17R60 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IMPG1Q17R60 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IMPG1Q17R60 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IMPG1Q17R60 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IMPG1Q17R60 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IMPG1Q17R60 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IMPG1Q17R60 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IMPG1Q17R60 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IMPG1Q17R60 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IMPG1Q17R60 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IMPG1Q17R60 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IMPG1Q17R60 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IMPG1Q17R60 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IMPG1Q17R60 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IMPG1Q17R60 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IMPG1Q17R60 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IMPG1Q17R60 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IMPG1Q17R60 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IMPG1Q17R60 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IMPG1Q17R60 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IMPG1Q17R60 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IMPG1Q17R60 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IMPG1Q17R60 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IMPG1Q17R60 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IMPG1Q17R60 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IMPG1Q17R60 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IMPG1Q17R60 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IMPG1Q17R60 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IMPG1Q17R60 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IMPG1Q17R60 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IMPG1Q17R60 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IMPG1Q17R60 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IMPG1Q17R60 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IMPG1Q17R60 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
IMPG1Q17R60 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
IMPG1Q17R60 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IMPG1Q17R60 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IMPG1Q17R60 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IMPG1Q17R60 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IMPG1Q17R60 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IMPG1Q17R60 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IMPG1Q17R60 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IMPG1Q17R60 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IMPG1Q17R60 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IMPG1Q17R60 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
IMPG1Q17R60 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IMPG1Q17R60 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.6 ms