Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NECTIN1Q15223 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NECTIN1Q15223 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NECTIN1Q15223 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
NECTIN1Q15223 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NECTIN1Q15223 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NECTIN1Q15223 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NECTIN1Q15223 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NECTIN1Q15223 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NECTIN1Q15223 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NECTIN1Q15223 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NECTIN1Q15223 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NECTIN1Q15223 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NECTIN1Q15223 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NECTIN1Q15223 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NECTIN1Q15223 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NECTIN1Q15223 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NECTIN1Q15223 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NECTIN1Q15223 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NECTIN1Q15223 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NECTIN1Q15223 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NECTIN1Q15223 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NECTIN1Q15223 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NECTIN1Q15223 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NECTIN1Q15223 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NECTIN1Q15223 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
NECTIN1Q15223 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
NECTIN1Q15223 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
NECTIN1Q15223 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
NECTIN1Q15223 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
NECTIN1Q15223 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
NECTIN1Q15223 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
NECTIN1Q15223 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
NECTIN1Q15223 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
NECTIN1Q15223 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NECTIN1Q15223 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NECTIN1Q15223 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
NECTIN1Q15223 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NECTIN1Q15223 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
NECTIN1Q15223 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
NECTIN1Q15223 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
NECTIN1Q15223 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NECTIN1Q15223 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
NECTIN1Q15223 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NECTIN1Q15223 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30■■■□□ 2.39
NECTIN1Q15223 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NECTIN1Q15223 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
NECTIN1Q15223 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NECTIN1Q15223 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NECTIN1Q15223 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NECTIN1Q15223 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NECTIN1Q15223 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NECTIN1Q15223 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NECTIN1Q15223 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NECTIN1Q15223 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NECTIN1Q15223 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NECTIN1Q15223 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NECTIN1Q15223 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NECTIN1Q15223 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NECTIN1Q15223 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NECTIN1Q15223 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NECTIN1Q15223 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NECTIN1Q15223 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NECTIN1Q15223 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NECTIN1Q15223 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
NECTIN1Q15223 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NECTIN1Q15223 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NECTIN1Q15223 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NECTIN1Q15223 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NECTIN1Q15223 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NECTIN1Q15223 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NECTIN1Q15223 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NECTIN1Q15223 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NECTIN1Q15223 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NECTIN1Q15223 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NECTIN1Q15223 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NECTIN1Q15223 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NECTIN1Q15223 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NECTIN1Q15223 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NECTIN1Q15223 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NECTIN1Q15223 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NECTIN1Q15223 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NECTIN1Q15223 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NECTIN1Q15223 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NECTIN1Q15223 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NECTIN1Q15223 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NECTIN1Q15223 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
NECTIN1Q15223 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NECTIN1Q15223 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NECTIN1Q15223 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NECTIN1Q15223 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NECTIN1Q15223 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NECTIN1Q15223 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NECTIN1Q15223 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NECTIN1Q15223 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NECTIN1Q15223 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NECTIN1Q15223 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NECTIN1Q15223 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NECTIN1Q15223 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NECTIN1Q15223 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
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