Protein–RNA interactions for Protein: Q15018

ABRAXAS2, BRISC complex subunit Abraxas 2, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS2Q15018 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABRAXAS2Q15018 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABRAXAS2Q15018 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABRAXAS2Q15018 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABRAXAS2Q15018 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABRAXAS2Q15018 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABRAXAS2Q15018 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABRAXAS2Q15018 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABRAXAS2Q15018 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABRAXAS2Q15018 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABRAXAS2Q15018 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABRAXAS2Q15018 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABRAXAS2Q15018 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABRAXAS2Q15018 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABRAXAS2Q15018 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABRAXAS2Q15018 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABRAXAS2Q15018 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABRAXAS2Q15018 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABRAXAS2Q15018 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABRAXAS2Q15018 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABRAXAS2Q15018 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ABRAXAS2Q15018 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABRAXAS2Q15018 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABRAXAS2Q15018 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABRAXAS2Q15018 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABRAXAS2Q15018 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABRAXAS2Q15018 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ABRAXAS2Q15018 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABRAXAS2Q15018 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABRAXAS2Q15018 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABRAXAS2Q15018 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABRAXAS2Q15018 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABRAXAS2Q15018 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABRAXAS2Q15018 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABRAXAS2Q15018 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABRAXAS2Q15018 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABRAXAS2Q15018 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABRAXAS2Q15018 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABRAXAS2Q15018 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABRAXAS2Q15018 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABRAXAS2Q15018 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABRAXAS2Q15018 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABRAXAS2Q15018 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABRAXAS2Q15018 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABRAXAS2Q15018 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABRAXAS2Q15018 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABRAXAS2Q15018 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABRAXAS2Q15018 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABRAXAS2Q15018 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABRAXAS2Q15018 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABRAXAS2Q15018 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABRAXAS2Q15018 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABRAXAS2Q15018 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABRAXAS2Q15018 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ABRAXAS2Q15018 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ABRAXAS2Q15018 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ABRAXAS2Q15018 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABRAXAS2Q15018 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABRAXAS2Q15018 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABRAXAS2Q15018 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABRAXAS2Q15018 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABRAXAS2Q15018 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABRAXAS2Q15018 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABRAXAS2Q15018 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABRAXAS2Q15018 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABRAXAS2Q15018 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABRAXAS2Q15018 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABRAXAS2Q15018 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABRAXAS2Q15018 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABRAXAS2Q15018 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABRAXAS2Q15018 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABRAXAS2Q15018 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABRAXAS2Q15018 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABRAXAS2Q15018 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABRAXAS2Q15018 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABRAXAS2Q15018 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABRAXAS2Q15018 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABRAXAS2Q15018 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABRAXAS2Q15018 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABRAXAS2Q15018 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABRAXAS2Q15018 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABRAXAS2Q15018 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABRAXAS2Q15018 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABRAXAS2Q15018 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABRAXAS2Q15018 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABRAXAS2Q15018 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABRAXAS2Q15018 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABRAXAS2Q15018 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABRAXAS2Q15018 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABRAXAS2Q15018 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ABRAXAS2Q15018 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABRAXAS2Q15018 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABRAXAS2Q15018 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABRAXAS2Q15018 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABRAXAS2Q15018 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ABRAXAS2Q15018 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABRAXAS2Q15018 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABRAXAS2Q15018 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABRAXAS2Q15018 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABRAXAS2Q15018 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms