Protein–RNA interactions for Protein: Q13477

MADCAM1, Mucosal addressin cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MADCAM1Q13477 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MADCAM1Q13477 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MADCAM1Q13477 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MADCAM1Q13477 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MADCAM1Q13477 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MADCAM1Q13477 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MADCAM1Q13477 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MADCAM1Q13477 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MADCAM1Q13477 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MADCAM1Q13477 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MADCAM1Q13477 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MADCAM1Q13477 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MADCAM1Q13477 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MADCAM1Q13477 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MADCAM1Q13477 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MADCAM1Q13477 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MADCAM1Q13477 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MADCAM1Q13477 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MADCAM1Q13477 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MADCAM1Q13477 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MADCAM1Q13477 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MADCAM1Q13477 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MADCAM1Q13477 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MADCAM1Q13477 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MADCAM1Q13477 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MADCAM1Q13477 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MADCAM1Q13477 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MADCAM1Q13477 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MADCAM1Q13477 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MADCAM1Q13477 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MADCAM1Q13477 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MADCAM1Q13477 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MADCAM1Q13477 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MADCAM1Q13477 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MADCAM1Q13477 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MADCAM1Q13477 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MADCAM1Q13477 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MADCAM1Q13477 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MADCAM1Q13477 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MADCAM1Q13477 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MADCAM1Q13477 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MADCAM1Q13477 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MADCAM1Q13477 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MADCAM1Q13477 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MADCAM1Q13477 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MADCAM1Q13477 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MADCAM1Q13477 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MADCAM1Q13477 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MADCAM1Q13477 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MADCAM1Q13477 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MADCAM1Q13477 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MADCAM1Q13477 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MADCAM1Q13477 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MADCAM1Q13477 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MADCAM1Q13477 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MADCAM1Q13477 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MADCAM1Q13477 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MADCAM1Q13477 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MADCAM1Q13477 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MADCAM1Q13477 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MADCAM1Q13477 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MADCAM1Q13477 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MADCAM1Q13477 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MADCAM1Q13477 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MADCAM1Q13477 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MADCAM1Q13477 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MADCAM1Q13477 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MADCAM1Q13477 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MADCAM1Q13477 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MADCAM1Q13477 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MADCAM1Q13477 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MADCAM1Q13477 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MADCAM1Q13477 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MADCAM1Q13477 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MADCAM1Q13477 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MADCAM1Q13477 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MADCAM1Q13477 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MADCAM1Q13477 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MADCAM1Q13477 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MADCAM1Q13477 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MADCAM1Q13477 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MADCAM1Q13477 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MADCAM1Q13477 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MADCAM1Q13477 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MADCAM1Q13477 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MADCAM1Q13477 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MADCAM1Q13477 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MADCAM1Q13477 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MADCAM1Q13477 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MADCAM1Q13477 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MADCAM1Q13477 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MADCAM1Q13477 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MADCAM1Q13477 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MADCAM1Q13477 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MADCAM1Q13477 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MADCAM1Q13477 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MADCAM1Q13477 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MADCAM1Q13477 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MADCAM1Q13477 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MADCAM1Q13477 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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