Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMED1Q13445 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMED1Q13445 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMED1Q13445 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMED1Q13445 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMED1Q13445 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMED1Q13445 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMED1Q13445 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMED1Q13445 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMED1Q13445 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TMED1Q13445 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMED1Q13445 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMED1Q13445 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMED1Q13445 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMED1Q13445 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TMED1Q13445 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMED1Q13445 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMED1Q13445 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMED1Q13445 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMED1Q13445 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMED1Q13445 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMED1Q13445 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMED1Q13445 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMED1Q13445 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMED1Q13445 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMED1Q13445 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMED1Q13445 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMED1Q13445 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMED1Q13445 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMED1Q13445 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMED1Q13445 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMED1Q13445 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMED1Q13445 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMED1Q13445 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMED1Q13445 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMED1Q13445 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMED1Q13445 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMED1Q13445 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMED1Q13445 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMED1Q13445 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMED1Q13445 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMED1Q13445 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMED1Q13445 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMED1Q13445 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMED1Q13445 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMED1Q13445 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMED1Q13445 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMED1Q13445 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMED1Q13445 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMED1Q13445 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMED1Q13445 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMED1Q13445 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMED1Q13445 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMED1Q13445 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMED1Q13445 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMED1Q13445 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMED1Q13445 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMED1Q13445 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMED1Q13445 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMED1Q13445 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMED1Q13445 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMED1Q13445 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMED1Q13445 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMED1Q13445 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMED1Q13445 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMED1Q13445 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMED1Q13445 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMED1Q13445 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMED1Q13445 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMED1Q13445 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMED1Q13445 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMED1Q13445 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMED1Q13445 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMED1Q13445 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMED1Q13445 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMED1Q13445 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMED1Q13445 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMED1Q13445 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMED1Q13445 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMED1Q13445 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMED1Q13445 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMED1Q13445 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMED1Q13445 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMED1Q13445 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMED1Q13445 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMED1Q13445 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMED1Q13445 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMED1Q13445 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMED1Q13445 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMED1Q13445 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMED1Q13445 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMED1Q13445 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMED1Q13445 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMED1Q13445 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMED1Q13445 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMED1Q13445 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMED1Q13445 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMED1Q13445 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMED1Q13445 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMED1Q13445 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
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