Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 RBM26-204ENST00000449987 3662 ntTSL 310.82□□□□□ -0.683e-24■■■■■ 54.1
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PABPC4Q13310 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.119e-8■■■■■ 53.9
PABPC4Q13310 SLC25A10-206ENST00000573246 898 ntTSL 316.38■□□□□ 0.212e-10■■■■■ 53.7
PABPC4Q13310 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.092e-12■■■■■ 53.7
PABPC4Q13310 MYL4-208ENST00000572316 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.082e-12■■■■■ 53.7
PABPC4Q13310 MYL4-201ENST00000354968 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.392e-12■■■■■ 53.7
PABPC4Q13310 MYL4-206ENST00000571981 920 ntTSL 312.61□□□□□ -0.392e-12■■■■■ 53.7
PABPC4Q13310 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.275e-22■■■■■ 53.3
PABPC4Q13310 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.165e-22■■■■■ 53.3
PABPC4Q13310 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.015e-22■■■■■ 53.3
PABPC4Q13310 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.945e-22■■■■■ 53.3
PABPC4Q13310 NR1H2-203ENST00000593532 2380 ntTSL 219.25■□□□□ 0.675e-22■■■■■ 53.3
PABPC4Q13310 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.273e-9■■■■■ 53.3
PABPC4Q13310 ANKRD13D-208ENST00000507915 1165 ntTSL 322.93■■□□□ 1.263e-9■■■■■ 53.3
PABPC4Q13310 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.23e-9■■■■■ 53.3
PABPC4Q13310 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.113e-9■■■■■ 53.3
PABPC4Q13310 ANKRD13D-210ENST00000508422 477 ntTSL 221.31■■□□□ 13e-9■■■■■ 53.3
PABPC4Q13310 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.953e-9■■■■■ 53.3
PABPC4Q13310 ANKRD13D-204ENST00000504236 580 ntTSL 320.7■□□□□ 0.93e-9■■■■■ 53.3
PABPC4Q13310 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.93e-9■■■■■ 53.3
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PABPC4Q13310 ANKRD13D-209ENST00000508417 2009 ntTSL 219.04■□□□□ 0.643e-9■■■■■ 53.3
PABPC4Q13310 ANKRD13D-213ENST00000512231 2768 ntTSL 214.9□□□□□ -0.023e-9■■■■■ 53.3
PABPC4Q13310 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.072e-12■■■■■ 53.1
PABPC4Q13310 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.932e-12■■■■■ 53.1
PABPC4Q13310 FAH-203ENST00000537726 1396 ntTSL 223.78■■□□□ 1.42e-12■■■■■ 53.1
PABPC4Q13310 FAH-208ENST00000558767 2087 ntTSL 223.75■■□□□ 1.392e-12■■■■■ 53.1
PABPC4Q13310 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 12e-12■■■■■ 53.1
PABPC4Q13310 MED24-220ENST00000579364 823 ntTSL 221.14■□□□□ 0.972e-12■■■■■ 53.1
PABPC4Q13310 FAH-212ENST00000561369 746 ntTSL 320.25■□□□□ 0.832e-12■■■■■ 53.1
PABPC4Q13310 MED24-205ENST00000422942 905 ntTSL 1 (best)18.72■□□□□ 0.592e-12■■■■■ 53.1
PABPC4Q13310 FAH-205ENST00000558022 568 ntTSL 418.19■□□□□ 0.52e-12■■■■■ 53.1
PABPC4Q13310 MED24-212ENST00000501516 3037 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.272e-12■■■■■ 53.1
PABPC4Q13310 DPP3-214ENST00000539085 391 ntTSL 29.91□□□□□ -0.825e-35■■■■■ 53.1
PABPC4Q13310 CCNC-206ENST00000486428 849 ntTSL 36.94□□□□□ -1.35e-35■■■■■ 53.1
PABPC4Q13310 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.419e-13■■■■■ 53.1
PABPC4Q13310 UBTF-206ENST00000527034 3010 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.119e-13■■■■■ 53.1
PABPC4Q13310 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.051e-323■■■■■ 53.1
PABPC4Q13310 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.174e-10■■■■■ 53
PABPC4Q13310 AP000781.2-201ENST00000534081 1639 ntTSL 215.74■□□□□ 0.111e-10■■■■■ 52.9
PABPC4Q13310 NOC2L-204ENST00000483767 1611 ntTSL 221.54■■□□□ 1.043e-8■■■■■ 52.9
PABPC4Q13310 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.183e-8■■■■■ 52.9
PABPC4Q13310 NOC2L-203ENST00000477976 4201 ntTSL 512.78□□□□□ -0.363e-8■■■■■ 52.9
PABPC4Q13310 PABPC1-219ENST00000522387 2331 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.131e-323■■■■■ 52.7
PABPC4Q13310 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.872e-6■■■■■ 52.6
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PABPC4Q13310 RAP1GAP-201ENST00000290101 3584 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.222e-6■■■■■ 52.6
PABPC4Q13310 RAP1GAP-205ENST00000374763 3334 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.332e-6■■■■■ 52.6
PABPC4Q13310 RAP1GAP-206ENST00000374765 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.332e-6■■■■■ 52.6
PABPC4Q13310 RAP1GAP-209ENST00000471600 3238 ntTSL 512.75□□□□□ -0.372e-6■■■■■ 52.6
PABPC4Q13310 RAP1GAP-212ENST00000542643 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.662e-6■■■■■ 52.6
PABPC4Q13310 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.118e-11■■■■■ 52.5
PABPC4Q13310 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.118e-11■■■■■ 52.5
PABPC4Q13310 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.151e-10■■■■■ 52.4
PABPC4Q13310 TCF4-202ENST00000356073 8317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.411e-10■■■■■ 52.4
PABPC4Q13310 TCF4-276ENST00000635822 7805 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.411e-10■■■■■ 52.4
PABPC4Q13310 TCF4-283ENST00000637115 7883 ntTSL 58.18□□□□□ -1.11e-10■■■■■ 52.4
PABPC4Q13310 TCF4-285ENST00000637239 7771 ntTSL 57.64□□□□□ -1.191e-10■■■■■ 52.4
PABPC4Q13310 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.191e-10■■■■■ 52.4
PABPC4Q13310 TCF4-286ENST00000637250 7410 ntTSL 57.48□□□□□ -1.211e-10■■■■■ 52.4
PABPC4Q13310 TCF4-277ENST00000635990 7396 ntTSL 57.23□□□□□ -1.251e-10■■■■■ 52.4
PABPC4Q13310 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.261e-10■■■■■ 52.4
PABPC4Q13310 TCF4-288ENST00000637923 7314 ntTSL 56.06□□□□□ -1.441e-10■■■■■ 52.4
PABPC4Q13310 TCF4-280ENST00000636751 8283 ntTSL 55.64□□□□□ -1.511e-10■■■■■ 52.4
PABPC4Q13310 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.521e-10■■■■■ 52.4
PABPC4Q13310 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.551e-10■■■■■ 52.4
PABPC4Q13310 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.471e-7■■■■■ 52.2
PABPC4Q13310 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.422e-7■■■■■ 52.2
PABPC4Q13310 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.062e-7■■■■■ 52.2
PABPC4Q13310 AC010894.3-201ENST00000442996 2400 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.973e-21■■■■■ 52.2
PABPC4Q13310 SVBP-203ENST00000497437 708 ntTSL 310.85□□□□□ -0.679e-8■■■■■ 52
PABPC4Q13310 APOC1-204ENST00000589078 213 ntTSL 211.51□□□□□ -0.573e-8■■■■■ 52
PABPC4Q13310 RPL18A-207ENST00000602216 907 ntTSL 220.19■□□□□ 0.821e-45■■■■■ 52
PABPC4Q13310 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.081e-323■■■■■ 51.9
PABPC4Q13310 MXD4-204ENST00000513380 624 ntTSL 515.3■□□□□ 0.047e-7■■■■■ 51.8
PABPC4Q13310 MXD4-203ENST00000513372 4228 ntTSL 215.22■□□□□ 0.037e-7■■■■■ 51.8
PABPC4Q13310 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.231e-15■■■■■ 51.6
PABPC4Q13310 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.111e-15■■■■■ 51.6
PABPC4Q13310 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.991e-15■■■■■ 51.6
PABPC4Q13310 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.822e-7■■■■■ 51.3
PABPC4Q13310 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.442e-7■■■■■ 51.3
PABPC4Q13310 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.472e-7■■■■■ 51.3
PABPC4Q13310 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.933e-13■■■■■ 51.3
PABPC4Q13310 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.733e-13■■■■■ 51.3
PABPC4Q13310 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.213e-13■■■■■ 51.3
PABPC4Q13310 IRF3-220ENST00000598108 1118 ntTSL 327.22■■□□□ 1.956e-12■■■■■ 51.2
PABPC4Q13310 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.296e-12■■■■■ 51.2
PABPC4Q13310 MRPS11-209ENST00000560708 1060 ntTSL 216.72■□□□□ 0.276e-12■■■■■ 51.2
PABPC4Q13310 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.176e-12■■■■■ 51.2
PABPC4Q13310 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.176e-12■■■■■ 51.2
PABPC4Q13310 MRPS11-204ENST00000558406 918 ntTSL 215.46■□□□□ 0.076e-12■■■■■ 51.2
PABPC4Q13310 DCLRE1C-208ENST00000378258 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.126e-12■■■■■ 51.2
PABPC4Q13310 MRPS11-207ENST00000559323 2002 ntTSL 214.1□□□□□ -0.156e-12■■■■■ 51.2
PABPC4Q13310 DCLRE1C-210ENST00000378289 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.346e-12■■■■■ 51.2
PABPC4Q13310 ZNF691-203ENST00000372504 1935 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.356e-12■■■■■ 51.2
PABPC4Q13310 ZNF691-204ENST00000372506 1859 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.426e-12■■■■■ 51.2
PABPC4Q13310 ZNF691-205ENST00000372507 1683 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.456e-12■■■■■ 51.2
PABPC4Q13310 ZNF691-208ENST00000630961 1581 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.556e-12■■■■■ 51.2
PABPC4Q13310 DCLRE1C-201ENST00000357717 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.586e-12■■■■■ 51.2
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