RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507915.1

ANKRD13D-208, Transcript of ankyrin repeat domain 13D, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD13D, Length 1,165 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD13D-208ENST00000507915 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.29■■■■■ 5
ANKRD13D-208ENST00000507915 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.28■■■■■ 4.2
ANKRD13D-208ENST00000507915 ABCC9O60706 1549 aa41.03■■■■■ 4.16
ANKRD13D-208ENST00000507915 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.92■■■■□ 3.82
ANKRD13D-208ENST00000507915 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.85■■■■□ 3.81
ANKRD13D-208ENST00000507915 NACADO15069 1562 aa38.85■■■■□ 3.81
ANKRD13D-208ENST00000507915 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.75■■■■□ 3.79
ANKRD13D-208ENST00000507915 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.6■■■■□ 3.77
ANKRD13D-208ENST00000507915 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.54■■■■□ 3.76
ANKRD13D-208ENST00000507915 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.38■■■■□ 3.73
ANKRD13D-208ENST00000507915 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.24■■■■□ 3.712e-9■■■■□ 20.5
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ANKRD13D-208ENST00000507915 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.58■■■■□ 3.61
ANKRD13D-208ENST00000507915 SCRIBQ14160 1630 aa37.55■■■■□ 3.6
ANKRD13D-208ENST00000507915 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.43■■■■□ 3.58
ANKRD13D-208ENST00000507915 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.01■■■■□ 3.51
ANKRD13D-208ENST00000507915 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.94■■■■□ 3.5
ANKRD13D-208ENST00000507915 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.77■■■■□ 3.48
ANKRD13D-208ENST00000507915 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.03■■■■□ 3.36
ANKRD13D-208ENST00000507915 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.97■■■■□ 3.35
ANKRD13D-208ENST00000507915 SMARCA4P51532 1647 aa35.94■■■■□ 3.34
ANKRD13D-208ENST00000507915 SMARCA2P51531 1590 aa35.83■■■■□ 3.33
ANKRD13D-208ENST00000507915 NCAPD3P42695 1498 aa35.8■■■■□ 3.32
ANKRD13D-208ENST00000507915 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.76■■■■□ 3.32
ANKRD13D-208ENST00000507915 HMGXB3Q12766 1538 aa35.64■■■■□ 3.3
ANKRD13D-208ENST00000507915 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.62■■■■□ 3.29
ANKRD13D-208ENST00000507915 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.59■■■■□ 3.29
ANKRD13D-208ENST00000507915 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.54■■■■□ 3.28
ANKRD13D-208ENST00000507915 ERCC6Q03468 1493 aa35.53■■■■□ 3.28
ANKRD13D-208ENST00000507915 CUX2O14529 1486 aa35.49■■■■□ 3.27
ANKRD13D-208ENST00000507915 WIZO95785 1651 aa35.21■■■■□ 3.23
ANKRD13D-208ENST00000507915 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.19■■■■□ 3.22
ANKRD13D-208ENST00000507915 NESP48681 1621 aa35.08■■■■□ 3.21
ANKRD13D-208ENST00000507915 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.93■■■■□ 3.18
ANKRD13D-208ENST00000507915 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.91■■■■□ 3.18
ANKRD13D-208ENST00000507915 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.75■■■■□ 3.15
ANKRD13D-208ENST00000507915 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.72■■■■□ 3.15
ANKRD13D-208ENST00000507915 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.69■■■■□ 3.14
ANKRD13D-208ENST00000507915 CFTRP13569 1480 aa34.52■■■■□ 3.12
ANKRD13D-208ENST00000507915 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.48■■■■□ 3.11
ANKRD13D-208ENST00000507915 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.46■■■■□ 3.11
ANKRD13D-208ENST00000507915 TRIM41Q8WV44 630 aa34.4■■■■□ 3.1
ANKRD13D-208ENST00000507915 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.36■■■■□ 3.09
ANKRD13D-208ENST00000507915 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.35■■■■□ 3.09
ANKRD13D-208ENST00000507915 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.33■■■■□ 3.09
ANKRD13D-208ENST00000507915 PRDM2Q13029 1718 aa34.27■■■■□ 3.08
ANKRD13D-208ENST00000507915 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.26■■■■□ 3.08
ANKRD13D-208ENST00000507915 WDR62O43379 1518 aa34.19■■■■□ 3.06
ANKRD13D-208ENST00000507915 OSCARQ8IYS5 282 aa33.96■■■■□ 3.03
ANKRD13D-208ENST00000507915 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.93■■■■□ 3.02
ANKRD13D-208ENST00000507915 ABCC8Q09428 1581 aa33.92■■■■□ 3.02
ANKRD13D-208ENST00000507915 TOPBP1Q92547 1522 aa33.76■■■■□ 3
ANKRD13D-208ENST00000507915 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.76■■■□□ 2.99
ANKRD13D-208ENST00000507915 IFT140Q96RY7 1462 aa33.64■■■□□ 2.98
ANKRD13D-208ENST00000507915 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.46■■■□□ 2.95
ANKRD13D-208ENST00000507915 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.43■■■□□ 2.94
ANKRD13D-208ENST00000507915 CUX1P39880 1505 aa33.42■■■□□ 2.94
ANKRD13D-208ENST00000507915 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.37■■■□□ 2.93
ANKRD13D-208ENST00000507915 SOGA1O94964 1423 aa33.36■■■□□ 2.93
ANKRD13D-208ENST00000507915 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.36■■■□□ 2.93
ANKRD13D-208ENST00000507915 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.35■■■□□ 2.93
ANKRD13D-208ENST00000507915 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.35■■■□□ 2.93
ANKRD13D-208ENST00000507915 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.35■■■□□ 2.93
ANKRD13D-208ENST00000507915 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.3■■■□□ 2.92
ANKRD13D-208ENST00000507915 WDR97A6NE52 1622 aa33.28■■■□□ 2.92
ANKRD13D-208ENST00000507915 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.28■■■□□ 2.92
ANKRD13D-208ENST00000507915 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.25■■■□□ 2.91
ANKRD13D-208ENST00000507915 ARHGEF11O15085 1522 aa33.25■■■□□ 2.91
ANKRD13D-208ENST00000507915 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.22■■■□□ 2.91
ANKRD13D-208ENST00000507915 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.18■■■□□ 2.92e-6■■■■□ 26.4
ANKRD13D-208ENST00000507915 TOP2BQ02880 1626 aa33.18■■■□□ 2.9
ANKRD13D-208ENST00000507915 FBLN2P98095 1184 aa33.18■■■□□ 2.9
ANKRD13D-208ENST00000507915 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.17■■■□□ 2.9
ANKRD13D-208ENST00000507915 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.12■■■□□ 2.89
ANKRD13D-208ENST00000507915 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.08■■■□□ 2.89
ANKRD13D-208ENST00000507915 SYNJ1O43426 1573 aa33.08■■■□□ 2.89
ANKRD13D-208ENST00000507915 TRHP20396 242 aaPredicted RBP33.05■■■□□ 2.88
ANKRD13D-208ENST00000507915 GRIN2BQ13224 1484 aa33.02■■■□□ 2.88
ANKRD13D-208ENST00000507915 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.99■■■□□ 2.87
ANKRD13D-208ENST00000507915 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.97■■■□□ 2.87
ANKRD13D-208ENST00000507915 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.93■■■□□ 2.86
ANKRD13D-208ENST00000507915 CHD1O14646 1710 aa32.92■■■□□ 2.86
ANKRD13D-208ENST00000507915 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.91■■■□□ 2.86
ANKRD13D-208ENST00000507915 PBRM1Q86U86 1689 aa32.89■■■□□ 2.86
ANKRD13D-208ENST00000507915 ARAP1Q96P48 1450 aa32.89■■■□□ 2.86
ANKRD13D-208ENST00000507915 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.85■■■□□ 2.85
ANKRD13D-208ENST00000507915 SYNJ2O15056 1496 aa32.81■■■□□ 2.84
ANKRD13D-208ENST00000507915 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.73■■■□□ 2.83
ANKRD13D-208ENST00000507915 KIF27Q86VH2 1401 aa32.65■■■□□ 2.82
ANKRD13D-208ENST00000507915 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.63■■■□□ 2.81
ANKRD13D-208ENST00000507915 ADAMTS12P58397 1594 aa32.62■■■□□ 2.81
ANKRD13D-208ENST00000507915 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.58■■■□□ 2.81
ANKRD13D-208ENST00000507915 GRIN2AQ12879 1464 aa32.56■■■□□ 2.8
ANKRD13D-208ENST00000507915 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP32.43■■■□□ 2.78
ANKRD13D-208ENST00000507915 CUL7Q14999 1698 aa32.43■■■□□ 2.78
ANKRD13D-208ENST00000507915 NUP160Q12769 1436 aa32.41■■■□□ 2.78
ANKRD13D-208ENST00000507915 IGF1RP08069 1367 aa32.39■■■□□ 2.78
ANKRD13D-208ENST00000507915 CEP170Q5SW79 1584 aa32.32■■■□□ 2.77
ANKRD13D-208ENST00000507915 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.27■■■□□ 2.76
ANKRD13D-208ENST00000507915 SHROOM2Q13796 1616 aa32.15■■■□□ 2.74
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