Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACTN3Q08043 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACTN3Q08043 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACTN3Q08043 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACTN3Q08043 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ACTN3Q08043 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACTN3Q08043 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACTN3Q08043 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACTN3Q08043 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACTN3Q08043 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACTN3Q08043 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACTN3Q08043 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACTN3Q08043 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACTN3Q08043 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACTN3Q08043 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ACTN3Q08043 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACTN3Q08043 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACTN3Q08043 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACTN3Q08043 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACTN3Q08043 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACTN3Q08043 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACTN3Q08043 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACTN3Q08043 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACTN3Q08043 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACTN3Q08043 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACTN3Q08043 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACTN3Q08043 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACTN3Q08043 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACTN3Q08043 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACTN3Q08043 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACTN3Q08043 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACTN3Q08043 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACTN3Q08043 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACTN3Q08043 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ACTN3Q08043 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACTN3Q08043 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACTN3Q08043 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACTN3Q08043 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACTN3Q08043 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACTN3Q08043 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACTN3Q08043 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACTN3Q08043 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ACTN3Q08043 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACTN3Q08043 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACTN3Q08043 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACTN3Q08043 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACTN3Q08043 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACTN3Q08043 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ACTN3Q08043 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ACTN3Q08043 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ACTN3Q08043 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACTN3Q08043 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACTN3Q08043 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACTN3Q08043 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACTN3Q08043 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACTN3Q08043 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACTN3Q08043 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACTN3Q08043 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTN3Q08043 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTN3Q08043 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTN3Q08043 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTN3Q08043 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTN3Q08043 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTN3Q08043 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTN3Q08043 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ACTN3Q08043 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACTN3Q08043 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACTN3Q08043 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACTN3Q08043 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACTN3Q08043 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACTN3Q08043 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACTN3Q08043 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACTN3Q08043 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACTN3Q08043 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACTN3Q08043 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ACTN3Q08043 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACTN3Q08043 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACTN3Q08043 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACTN3Q08043 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACTN3Q08043 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACTN3Q08043 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACTN3Q08043 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACTN3Q08043 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACTN3Q08043 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACTN3Q08043 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACTN3Q08043 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTN3Q08043 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTN3Q08043 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTN3Q08043 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTN3Q08043 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTN3Q08043 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTN3Q08043 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTN3Q08043 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTN3Q08043 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTN3Q08043 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTN3Q08043 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTN3Q08043 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTN3Q08043 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTN3Q08043 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTN3Q08043 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms