Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SPTBN1Q01082 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPTBN1Q01082 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPTBN1Q01082 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPTBN1Q01082 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPTBN1Q01082 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTBN1Q01082 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTBN1Q01082 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTBN1Q01082 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTBN1Q01082 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTBN1Q01082 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTBN1Q01082 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTBN1Q01082 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTBN1Q01082 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTBN1Q01082 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTBN1Q01082 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTBN1Q01082 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTBN1Q01082 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTBN1Q01082 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTBN1Q01082 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTBN1Q01082 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTBN1Q01082 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTBN1Q01082 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTBN1Q01082 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTBN1Q01082 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPTBN1Q01082 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPTBN1Q01082 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPTBN1Q01082 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPTBN1Q01082 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SPTBN1Q01082 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPTBN1Q01082 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTBN1Q01082 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTBN1Q01082 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTBN1Q01082 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTBN1Q01082 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTBN1Q01082 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTBN1Q01082 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTBN1Q01082 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTBN1Q01082 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTBN1Q01082 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTBN1Q01082 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTBN1Q01082 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTBN1Q01082 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTBN1Q01082 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTBN1Q01082 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTBN1Q01082 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTBN1Q01082 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTBN1Q01082 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTBN1Q01082 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTBN1Q01082 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTBN1Q01082 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTBN1Q01082 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTBN1Q01082 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTBN1Q01082 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTBN1Q01082 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTBN1Q01082 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTBN1Q01082 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPTBN1Q01082 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPTBN1Q01082 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SPTBN1Q01082 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTBN1Q01082 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTBN1Q01082 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTBN1Q01082 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTBN1Q01082 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTBN1Q01082 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTBN1Q01082 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTBN1Q01082 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTBN1Q01082 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTBN1Q01082 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPTBN1Q01082 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SPTBN1Q01082 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPTBN1Q01082 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTBN1Q01082 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTBN1Q01082 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTBN1Q01082 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTBN1Q01082 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTBN1Q01082 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTBN1Q01082 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTBN1Q01082 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTBN1Q01082 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTBN1Q01082 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTBN1Q01082 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPTBN1Q01082 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPTBN1Q01082 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPTBN1Q01082 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPTBN1Q01082 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTBN1Q01082 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTBN1Q01082 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTBN1Q01082 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTBN1Q01082 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTBN1Q01082 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTBN1Q01082 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTBN1Q01082 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTBN1Q01082 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTBN1Q01082 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTBN1Q01082 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTBN1Q01082 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTBN1Q01082 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTBN1Q01082 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTBN1Q01082 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms