Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM3AP98173 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM3AP98173 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM3AP98173 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM3AP98173 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM3AP98173 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM3AP98173 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM3AP98173 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM3AP98173 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM3AP98173 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM3AP98173 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM3AP98173 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM3AP98173 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM3AP98173 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM3AP98173 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM3AP98173 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FAM3AP98173 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM3AP98173 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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