Protein–RNA interactions for Protein: P42765

ACAA2, 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA2P42765 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ACAA2P42765 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ACAA2P42765 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACAA2P42765 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACAA2P42765 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ACAA2P42765 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ACAA2P42765 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ACAA2P42765 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACAA2P42765 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACAA2P42765 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACAA2P42765 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACAA2P42765 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACAA2P42765 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACAA2P42765 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACAA2P42765 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACAA2P42765 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACAA2P42765 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACAA2P42765 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACAA2P42765 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACAA2P42765 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACAA2P42765 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACAA2P42765 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACAA2P42765 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACAA2P42765 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACAA2P42765 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACAA2P42765 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACAA2P42765 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACAA2P42765 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACAA2P42765 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ACAA2P42765 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACAA2P42765 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACAA2P42765 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACAA2P42765 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACAA2P42765 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACAA2P42765 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACAA2P42765 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACAA2P42765 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACAA2P42765 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACAA2P42765 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACAA2P42765 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACAA2P42765 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACAA2P42765 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACAA2P42765 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACAA2P42765 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACAA2P42765 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACAA2P42765 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACAA2P42765 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACAA2P42765 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACAA2P42765 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACAA2P42765 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACAA2P42765 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACAA2P42765 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACAA2P42765 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACAA2P42765 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACAA2P42765 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACAA2P42765 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACAA2P42765 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACAA2P42765 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACAA2P42765 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACAA2P42765 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACAA2P42765 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACAA2P42765 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACAA2P42765 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACAA2P42765 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACAA2P42765 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACAA2P42765 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACAA2P42765 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACAA2P42765 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ACAA2P42765 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ACAA2P42765 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ACAA2P42765 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ACAA2P42765 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ACAA2P42765 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ACAA2P42765 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ACAA2P42765 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ACAA2P42765 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ACAA2P42765 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ACAA2P42765 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACAA2P42765 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACAA2P42765 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACAA2P42765 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACAA2P42765 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ACAA2P42765 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ACAA2P42765 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ACAA2P42765 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACAA2P42765 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACAA2P42765 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACAA2P42765 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACAA2P42765 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACAA2P42765 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACAA2P42765 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACAA2P42765 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACAA2P42765 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACAA2P42765 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACAA2P42765 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACAA2P42765 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACAA2P42765 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACAA2P42765 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACAA2P42765 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACAA2P42765 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms