Protein–RNA interactions for Protein: P41595

HTR2B, 5-hydroxytryptamine receptor 2B, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2BP41595 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HTR2BP41595 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HTR2BP41595 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HTR2BP41595 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HTR2BP41595 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HTR2BP41595 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HTR2BP41595 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HTR2BP41595 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HTR2BP41595 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HTR2BP41595 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HTR2BP41595 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HTR2BP41595 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HTR2BP41595 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HTR2BP41595 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HTR2BP41595 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HTR2BP41595 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HTR2BP41595 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HTR2BP41595 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HTR2BP41595 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HTR2BP41595 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HTR2BP41595 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HTR2BP41595 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HTR2BP41595 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTR2BP41595 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTR2BP41595 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTR2BP41595 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HTR2BP41595 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HTR2BP41595 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HTR2BP41595 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HTR2BP41595 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HTR2BP41595 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HTR2BP41595 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HTR2BP41595 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HTR2BP41595 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HTR2BP41595 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HTR2BP41595 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HTR2BP41595 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HTR2BP41595 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HTR2BP41595 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HTR2BP41595 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HTR2BP41595 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HTR2BP41595 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HTR2BP41595 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HTR2BP41595 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HTR2BP41595 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HTR2BP41595 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HTR2BP41595 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HTR2BP41595 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HTR2BP41595 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HTR2BP41595 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HTR2BP41595 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HTR2BP41595 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HTR2BP41595 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HTR2BP41595 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HTR2BP41595 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HTR2BP41595 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
HTR2BP41595 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HTR2BP41595 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HTR2BP41595 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HTR2BP41595 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HTR2BP41595 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HTR2BP41595 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HTR2BP41595 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HTR2BP41595 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HTR2BP41595 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HTR2BP41595 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HTR2BP41595 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HTR2BP41595 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HTR2BP41595 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HTR2BP41595 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HTR2BP41595 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTR2BP41595 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTR2BP41595 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTR2BP41595 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTR2BP41595 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTR2BP41595 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTR2BP41595 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTR2BP41595 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HTR2BP41595 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HTR2BP41595 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HTR2BP41595 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HTR2BP41595 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HTR2BP41595 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HTR2BP41595 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HTR2BP41595 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HTR2BP41595 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HTR2BP41595 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HTR2BP41595 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HTR2BP41595 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HTR2BP41595 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HTR2BP41595 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTR2BP41595 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTR2BP41595 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTR2BP41595 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTR2BP41595 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTR2BP41595 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTR2BP41595 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTR2BP41595 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTR2BP41595 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTR2BP41595 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms