Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CASP1P29466 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CASP1P29466 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CASP1P29466 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CASP1P29466 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CASP1P29466 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CASP1P29466 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CASP1P29466 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CASP1P29466 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CASP1P29466 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CASP1P29466 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CASP1P29466 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CASP1P29466 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CASP1P29466 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CASP1P29466 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CASP1P29466 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CASP1P29466 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CASP1P29466 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CASP1P29466 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CASP1P29466 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CASP1P29466 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CASP1P29466 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CASP1P29466 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CASP1P29466 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CASP1P29466 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CASP1P29466 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CASP1P29466 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CASP1P29466 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CASP1P29466 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CASP1P29466 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CASP1P29466 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CASP1P29466 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CASP1P29466 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CASP1P29466 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CASP1P29466 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CASP1P29466 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CASP1P29466 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CASP1P29466 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CASP1P29466 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CASP1P29466 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CASP1P29466 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CASP1P29466 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CASP1P29466 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CASP1P29466 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CASP1P29466 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CASP1P29466 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CASP1P29466 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CASP1P29466 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CASP1P29466 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CASP1P29466 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CASP1P29466 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CASP1P29466 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CASP1P29466 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CASP1P29466 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CASP1P29466 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CASP1P29466 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CASP1P29466 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CASP1P29466 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CASP1P29466 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CASP1P29466 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CASP1P29466 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CASP1P29466 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CASP1P29466 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CASP1P29466 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CASP1P29466 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CASP1P29466 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CASP1P29466 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
CASP1P29466 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CASP1P29466 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CASP1P29466 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CASP1P29466 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CASP1P29466 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CASP1P29466 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CASP1P29466 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CASP1P29466 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CASP1P29466 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CASP1P29466 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CASP1P29466 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASP1P29466 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASP1P29466 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASP1P29466 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASP1P29466 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CASP1P29466 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CASP1P29466 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CASP1P29466 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CASP1P29466 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CASP1P29466 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CASP1P29466 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CASP1P29466 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CASP1P29466 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CASP1P29466 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CASP1P29466 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CASP1P29466 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CASP1P29466 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CASP1P29466 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CASP1P29466 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CASP1P29466 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CASP1P29466 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CASP1P29466 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CASP1P29466 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms