Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD34P28906 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD34P28906 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD34P28906 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD34P28906 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD34P28906 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CD34P28906 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD34P28906 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD34P28906 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD34P28906 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CD34P28906 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD34P28906 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD34P28906 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD34P28906 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD34P28906 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD34P28906 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD34P28906 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD34P28906 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD34P28906 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD34P28906 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD34P28906 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD34P28906 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD34P28906 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD34P28906 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD34P28906 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD34P28906 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD34P28906 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD34P28906 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD34P28906 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD34P28906 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CD34P28906 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CD34P28906 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CD34P28906 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CD34P28906 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD34P28906 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD34P28906 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD34P28906 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CD34P28906 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD34P28906 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CD34P28906 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CD34P28906 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD34P28906 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CD34P28906 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD34P28906 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CD34P28906 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD34P28906 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CD34P28906 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD34P28906 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD34P28906 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD34P28906 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CD34P28906 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CD34P28906 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD34P28906 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD34P28906 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD34P28906 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD34P28906 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD34P28906 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CD34P28906 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CD34P28906 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CD34P28906 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD34P28906 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD34P28906 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD34P28906 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CD34P28906 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD34P28906 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CD34P28906 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD34P28906 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD34P28906 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD34P28906 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD34P28906 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD34P28906 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD34P28906 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD34P28906 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD34P28906 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD34P28906 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD34P28906 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CD34P28906 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD34P28906 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD34P28906 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD34P28906 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD34P28906 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD34P28906 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD34P28906 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD34P28906 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD34P28906 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD34P28906 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD34P28906 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD34P28906 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD34P28906 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD34P28906 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD34P28906 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD34P28906 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD34P28906 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD34P28906 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD34P28906 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD34P28906 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CD34P28906 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD34P28906 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD34P28906 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD34P28906 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms