Protein–RNA interactions for Protein: P28702

RXRB, Retinoic acid receptor RXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRBP28702 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
RXRBP28702 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
RXRBP28702 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
RXRBP28702 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RXRBP28702 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RXRBP28702 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
RXRBP28702 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
RXRBP28702 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
RXRBP28702 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
RXRBP28702 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
RXRBP28702 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
RXRBP28702 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
RXRBP28702 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
RXRBP28702 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
RXRBP28702 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
RXRBP28702 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
RXRBP28702 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
RXRBP28702 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
RXRBP28702 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
RXRBP28702 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
RXRBP28702 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
RXRBP28702 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
RXRBP28702 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
RXRBP28702 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RXRBP28702 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RXRBP28702 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
RXRBP28702 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RXRBP28702 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RXRBP28702 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RXRBP28702 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RXRBP28702 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
RXRBP28702 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
RXRBP28702 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
RXRBP28702 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RXRBP28702 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RXRBP28702 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
RXRBP28702 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RXRBP28702 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC34.11■■■■□ 3.05
RXRBP28702 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
RXRBP28702 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
RXRBP28702 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RXRBP28702 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RXRBP28702 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
RXRBP28702 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
RXRBP28702 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RXRBP28702 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RXRBP28702 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RXRBP28702 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RXRBP28702 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RXRBP28702 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RXRBP28702 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RXRBP28702 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
RXRBP28702 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RXRBP28702 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
RXRBP28702 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
RXRBP28702 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
RXRBP28702 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RXRBP28702 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RXRBP28702 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RXRBP28702 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
RXRBP28702 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RXRBP28702 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RXRBP28702 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RXRBP28702 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RXRBP28702 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RXRBP28702 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
RXRBP28702 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RXRBP28702 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
RXRBP28702 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
RXRBP28702 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
RXRBP28702 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
RXRBP28702 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
RXRBP28702 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
RXRBP28702 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC34■■■■□ 3.03
RXRBP28702 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RXRBP28702 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RXRBP28702 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RXRBP28702 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RXRBP28702 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RXRBP28702 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RXRBP28702 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RXRBP28702 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RXRBP28702 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RXRBP28702 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RXRBP28702 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RXRBP28702 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RXRBP28702 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RXRBP28702 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RXRBP28702 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RXRBP28702 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RXRBP28702 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
RXRBP28702 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RXRBP28702 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
RXRBP28702 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RXRBP28702 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RXRBP28702 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RXRBP28702 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RXRBP28702 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RXRBP28702 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RXRBP28702 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.4 ms