Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SSFA2P28290 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SSFA2P28290 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SSFA2P28290 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SSFA2P28290 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
SSFA2P28290 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SSFA2P28290 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SSFA2P28290 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SSFA2P28290 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SSFA2P28290 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SSFA2P28290 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SSFA2P28290 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SSFA2P28290 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SSFA2P28290 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SSFA2P28290 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SSFA2P28290 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SSFA2P28290 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SSFA2P28290 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SSFA2P28290 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SSFA2P28290 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SSFA2P28290 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SSFA2P28290 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
SSFA2P28290 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
SSFA2P28290 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
SSFA2P28290 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SSFA2P28290 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SSFA2P28290 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SSFA2P28290 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SSFA2P28290 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SSFA2P28290 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SSFA2P28290 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SSFA2P28290 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SSFA2P28290 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SSFA2P28290 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SSFA2P28290 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SSFA2P28290 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SSFA2P28290 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SSFA2P28290 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SSFA2P28290 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
SSFA2P28290 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
SSFA2P28290 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
SSFA2P28290 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
SSFA2P28290 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SSFA2P28290 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SSFA2P28290 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SSFA2P28290 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SSFA2P28290 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SSFA2P28290 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SSFA2P28290 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SSFA2P28290 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SSFA2P28290 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SSFA2P28290 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SSFA2P28290 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SSFA2P28290 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
SSFA2P28290 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SSFA2P28290 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SSFA2P28290 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SSFA2P28290 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SSFA2P28290 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SSFA2P28290 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SSFA2P28290 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
SSFA2P28290 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
SSFA2P28290 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
SSFA2P28290 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SSFA2P28290 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SSFA2P28290 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
SSFA2P28290 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SSFA2P28290 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SSFA2P28290 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SSFA2P28290 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SSFA2P28290 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SSFA2P28290 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
SSFA2P28290 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SSFA2P28290 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SSFA2P28290 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
SSFA2P28290 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SSFA2P28290 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SSFA2P28290 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SSFA2P28290 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SSFA2P28290 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SSFA2P28290 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SSFA2P28290 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SSFA2P28290 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SSFA2P28290 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SSFA2P28290 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SSFA2P28290 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SSFA2P28290 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SSFA2P28290 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SSFA2P28290 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SSFA2P28290 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SSFA2P28290 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SSFA2P28290 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SSFA2P28290 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SSFA2P28290 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SSFA2P28290 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SSFA2P28290 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SSFA2P28290 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SSFA2P28290 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SSFA2P28290 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SSFA2P28290 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms