Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLNP26678 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLNP26678 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLNP26678 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLNP26678 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLNP26678 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLNP26678 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLNP26678 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLNP26678 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PLNP26678 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLNP26678 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLNP26678 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLNP26678 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLNP26678 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLNP26678 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLNP26678 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLNP26678 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLNP26678 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLNP26678 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLNP26678 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLNP26678 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLNP26678 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLNP26678 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLNP26678 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLNP26678 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLNP26678 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLNP26678 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLNP26678 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLNP26678 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLNP26678 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLNP26678 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLNP26678 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLNP26678 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLNP26678 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLNP26678 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLNP26678 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLNP26678 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLNP26678 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLNP26678 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLNP26678 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLNP26678 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLNP26678 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLNP26678 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLNP26678 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PLNP26678 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLNP26678 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PLNP26678 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PLNP26678 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PLNP26678 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PLNP26678 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PLNP26678 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PLNP26678 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PLNP26678 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PLNP26678 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PLNP26678 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PLNP26678 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PLNP26678 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLNP26678 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLNP26678 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLNP26678 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLNP26678 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLNP26678 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLNP26678 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLNP26678 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLNP26678 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLNP26678 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLNP26678 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLNP26678 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLNP26678 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLNP26678 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PLNP26678 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PLNP26678 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLNP26678 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLNP26678 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLNP26678 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLNP26678 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLNP26678 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLNP26678 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLNP26678 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLNP26678 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PLNP26678 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLNP26678 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLNP26678 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLNP26678 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLNP26678 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLNP26678 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLNP26678 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLNP26678 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PLNP26678 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PLNP26678 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PLNP26678 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PLNP26678 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PLNP26678 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PLNP26678 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PLNP26678 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLNP26678 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLNP26678 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLNP26678 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLNP26678 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLNP26678 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms