Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CXCL3P19876 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CXCL3P19876 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CXCL3P19876 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CXCL3P19876 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CXCL3P19876 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CXCL3P19876 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CXCL3P19876 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CXCL3P19876 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CXCL3P19876 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CXCL3P19876 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CXCL3P19876 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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