Protein–RNA interactions for Protein: P13073

COX4I1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I1P13073 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COX4I1P13073 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COX4I1P13073 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COX4I1P13073 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COX4I1P13073 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COX4I1P13073 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COX4I1P13073 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
COX4I1P13073 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
COX4I1P13073 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COX4I1P13073 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COX4I1P13073 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COX4I1P13073 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COX4I1P13073 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COX4I1P13073 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COX4I1P13073 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COX4I1P13073 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COX4I1P13073 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COX4I1P13073 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COX4I1P13073 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COX4I1P13073 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COX4I1P13073 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COX4I1P13073 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COX4I1P13073 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COX4I1P13073 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COX4I1P13073 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COX4I1P13073 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COX4I1P13073 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COX4I1P13073 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COX4I1P13073 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COX4I1P13073 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COX4I1P13073 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COX4I1P13073 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COX4I1P13073 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COX4I1P13073 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COX4I1P13073 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COX4I1P13073 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
COX4I1P13073 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COX4I1P13073 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COX4I1P13073 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COX4I1P13073 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COX4I1P13073 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COX4I1P13073 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
COX4I1P13073 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COX4I1P13073 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COX4I1P13073 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COX4I1P13073 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COX4I1P13073 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COX4I1P13073 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COX4I1P13073 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COX4I1P13073 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COX4I1P13073 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COX4I1P13073 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COX4I1P13073 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COX4I1P13073 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COX4I1P13073 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COX4I1P13073 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COX4I1P13073 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COX4I1P13073 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
COX4I1P13073 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COX4I1P13073 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COX4I1P13073 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COX4I1P13073 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COX4I1P13073 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COX4I1P13073 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COX4I1P13073 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COX4I1P13073 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COX4I1P13073 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COX4I1P13073 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COX4I1P13073 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
COX4I1P13073 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COX4I1P13073 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COX4I1P13073 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COX4I1P13073 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COX4I1P13073 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COX4I1P13073 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
COX4I1P13073 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COX4I1P13073 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COX4I1P13073 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COX4I1P13073 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COX4I1P13073 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COX4I1P13073 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COX4I1P13073 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COX4I1P13073 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COX4I1P13073 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COX4I1P13073 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COX4I1P13073 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COX4I1P13073 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COX4I1P13073 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COX4I1P13073 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COX4I1P13073 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COX4I1P13073 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COX4I1P13073 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COX4I1P13073 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
COX4I1P13073 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COX4I1P13073 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COX4I1P13073 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COX4I1P13073 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COX4I1P13073 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
COX4I1P13073 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COX4I1P13073 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms