Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IFNB1P01574 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
IFNB1P01574 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IFNB1P01574 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IFNB1P01574 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IFNB1P01574 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IFNB1P01574 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
IFNB1P01574 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IFNB1P01574 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
IFNB1P01574 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IFNB1P01574 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IFNB1P01574 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
IFNB1P01574 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
IFNB1P01574 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFNB1P01574 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFNB1P01574 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFNB1P01574 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFNB1P01574 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFNB1P01574 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFNB1P01574 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFNB1P01574 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFNB1P01574 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFNB1P01574 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFNB1P01574 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFNB1P01574 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFNB1P01574 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFNB1P01574 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFNB1P01574 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFNB1P01574 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFNB1P01574 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFNB1P01574 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFNB1P01574 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFNB1P01574 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFNB1P01574 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
IFNB1P01574 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFNB1P01574 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFNB1P01574 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFNB1P01574 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFNB1P01574 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFNB1P01574 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFNB1P01574 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFNB1P01574 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFNB1P01574 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFNB1P01574 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFNB1P01574 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFNB1P01574 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IFNB1P01574 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IFNB1P01574 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFNB1P01574 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFNB1P01574 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFNB1P01574 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFNB1P01574 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFNB1P01574 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFNB1P01574 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFNB1P01574 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFNB1P01574 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFNB1P01574 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFNB1P01574 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFNB1P01574 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFNB1P01574 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFNB1P01574 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFNB1P01574 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFNB1P01574 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFNB1P01574 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFNB1P01574 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFNB1P01574 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFNB1P01574 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFNB1P01574 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFNB1P01574 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFNB1P01574 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFNB1P01574 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFNB1P01574 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFNB1P01574 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFNB1P01574 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFNB1P01574 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFNB1P01574 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFNB1P01574 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFNB1P01574 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFNB1P01574 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFNB1P01574 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFNB1P01574 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFNB1P01574 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFNB1P01574 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFNB1P01574 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
IFNB1P01574 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFNB1P01574 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFNB1P01574 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
IFNB1P01574 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFNB1P01574 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFNB1P01574 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
IFNB1P01574 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
IFNB1P01574 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFNB1P01574 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFNB1P01574 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFNB1P01574 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFNB1P01574 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFNB1P01574 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFNB1P01574 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFNB1P01574 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFNB1P01574 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms