Protein–RNA interactions for Protein: O95977

S1PR4, Sphingosine 1-phosphate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1PR4O95977 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
S1PR4O95977 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
S1PR4O95977 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
S1PR4O95977 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
S1PR4O95977 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
S1PR4O95977 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
S1PR4O95977 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
S1PR4O95977 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
S1PR4O95977 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
S1PR4O95977 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
S1PR4O95977 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
S1PR4O95977 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
S1PR4O95977 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
S1PR4O95977 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
S1PR4O95977 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
S1PR4O95977 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
S1PR4O95977 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
S1PR4O95977 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
S1PR4O95977 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
S1PR4O95977 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
S1PR4O95977 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
S1PR4O95977 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
S1PR4O95977 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
S1PR4O95977 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
S1PR4O95977 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
S1PR4O95977 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
S1PR4O95977 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
S1PR4O95977 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
S1PR4O95977 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
S1PR4O95977 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
S1PR4O95977 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
S1PR4O95977 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
S1PR4O95977 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
S1PR4O95977 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
S1PR4O95977 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
S1PR4O95977 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
S1PR4O95977 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
S1PR4O95977 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
S1PR4O95977 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
S1PR4O95977 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
S1PR4O95977 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
S1PR4O95977 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
S1PR4O95977 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
S1PR4O95977 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
S1PR4O95977 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
S1PR4O95977 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
S1PR4O95977 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
S1PR4O95977 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
S1PR4O95977 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
S1PR4O95977 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
S1PR4O95977 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
S1PR4O95977 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
S1PR4O95977 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
S1PR4O95977 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
S1PR4O95977 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
S1PR4O95977 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
S1PR4O95977 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
S1PR4O95977 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
S1PR4O95977 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
S1PR4O95977 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
S1PR4O95977 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
S1PR4O95977 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
S1PR4O95977 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
S1PR4O95977 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
S1PR4O95977 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
S1PR4O95977 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
S1PR4O95977 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
S1PR4O95977 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
S1PR4O95977 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
S1PR4O95977 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
S1PR4O95977 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
S1PR4O95977 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
S1PR4O95977 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
S1PR4O95977 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
S1PR4O95977 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
S1PR4O95977 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
S1PR4O95977 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
S1PR4O95977 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
S1PR4O95977 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
S1PR4O95977 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
S1PR4O95977 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
S1PR4O95977 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
S1PR4O95977 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
S1PR4O95977 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
S1PR4O95977 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
S1PR4O95977 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
S1PR4O95977 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
S1PR4O95977 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
S1PR4O95977 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
S1PR4O95977 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
S1PR4O95977 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
S1PR4O95977 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
S1PR4O95977 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
S1PR4O95977 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
S1PR4O95977 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
S1PR4O95977 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
S1PR4O95977 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
S1PR4O95977 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
S1PR4O95977 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
S1PR4O95977 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms